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swimmingcrab

铜虫 (小有名气)

[交流] RNA电泳图分析

小弟最近再提一种蟹的RNA，如图，Marker使用的是DL2000的DNAmarker，在2000以一直会出现一条条带，第二条带仔细看的话会发现是两条。本来一直以为第一条是28s，后来发现所用trizol说明书上的28s大小都在2000以下（用的是同样的marker），DNase 处理之后第一条带就不见了。新鲜组织提出来的RNA也是这样。那这第一条带是不是DNA污染呢？第二条带是不是就是28S  18s没跑开合在一起了呢？求高手帮忙分析下


使用的是1%琼脂糖凝胶，150v  15min

电泳图.jpg
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1楼 2012-10-30 19:17:26
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dingxiuying

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
swimmingcrab(金币+1): 谢谢参与
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流经验 2012-10-31 15:13:44
我的经验是（针对植物的RNA）：
1、RNA中污染的DNA一般会在加样孔的最底端，不会分子量这么小。
2、RNA的电泳条带一般是28s、18s离得比较近，最下面是5s，有时跑变性胶是在18s下还会有两条带，应该是其他的组织中的RNA。
不知道动物组织中的RNA是否有所不同？
提取RNA是一个耗心的过程，要耐心。
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7楼2012-10-31 10:52:44
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)
★
swimmingcrab(金币+1): 谢谢参与
DNA污染会这么小吧，除非有特异的高拷贝质粒。你的RNA欲变性了吗？
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2楼2012-10-31 07:52:29
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swimmingcrab

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2012-10-31 07:52:29
DNA污染会这么小吧，除非有特异的高拷贝质粒。你的RNA欲变性了吗？

没有变性，提取出来测好浓度就电泳了
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3楼2012-10-31 08:28:27
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jl860822

金虫 (正式写手)
★
swimmingcrab(金币+1): 谢谢参与
RNA的构象和DNA的是不一样的，跑出来和DNA Marker的大小有出入是很正常的，只要三条带比较完整就差不多的
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4楼2012-10-31 08:56:04
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