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yu棒棒

新虫 (初入文坛)

[求助] PET-30a 双酶切

本人最近在做PET-30a的ECOR I 和NOT I的双酶切,可是做了好多次都没有成功,酶切后跑电泳仍是一条带,不知道是什么问题出了错,请高手指点下。
酶切体系如下: 5ul 质粒
                          1ul 10*H
                          1ul BSA
                          0.5ul ECOR I
                          0.5ul NOT I
                          2ul  H2O
酶切条件尝试过37度两小时,37度三小时,还尝试过37度过夜。
现在实验无法继续,跪求前辈指点,谢谢!
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zhwenxing

木虫 (著名写手)

尛森蟲

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+5, 鼓励积极应助 2012-10-30 16:04:09
yu棒棒: 金币+8, ★★★★★最佳答案 2012-10-30 22:24:46
1、双酶切,一般做:酶1单切,酶2单切,双酶切,不酶切,跑胶时候能够对照,甚至用另外一种常用的酶X单酶切,若X在插入片段有切点,而在载体上没有切点,就能知道你连接进去啦;
2、不知楼主采用的是什么牌子的RE?是TaKaRa的吗?Fermentas的快速酶切很好用;不论哪个牌子的,都可以。此常用载体不需要过夜酶切,时间长了还产生星活性呢!
3、 “5 ul”质粒这种说法希望以后就别再出现了,质粒的浓度不一样、大小不一样,mol数量太模糊了!注意不要加入太多的质粒,再就是质粒洗脱时注意用量,去除乙醇等的影响。
4、 可PCR先检测一下插入片段连进去了没有?
5、酶切体系不要扩大,双酶切时候,酶的用量要减少,我一般是0.5-0.7ul足以,常用的这些RE活性了得。

尝试一下吧~吼吼,希望对你有用。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2012-10-30 15:14:03
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yu棒棒

新虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhwenxing at 2012-10-30 15:14:03
1、双酶切,一般做:酶1单切,酶2单切,双酶切,不酶切,跑胶时候能够对照,甚至用另外一种常用的酶X单酶切,若X在插入片段有切点,而在载体上没有切点,就能知道你连接进去啦;
2、不知楼主采用的是什么牌子的RE? ...

非常感谢您的建议!
我是分子初入门者,很多问题都不是很理解,希望有机会能多跟您学习。
我现在想要做的是把双酶切后的目的基因连接到用RE双酶切的PET-30a上,但我用TaKaRa的RE切PET-30a, 怎么也切不开,所以我还没有进行到连接这一步骤。我电泳的时候一般都是点一个没切过的质粒做对照,结果总是出现一样的条带,我想尝试新的酶试试~
3楼2012-10-30 22:24:40
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by yu棒棒 at 2012-10-30 22:24:40
非常感谢您的建议!
我是分子初入门者,很多问题都不是很理解,希望有机会能多跟您学习。
我现在想要做的是把双酶切后的目的基因连接到用RE双酶切的PET-30a上,但我用TaKaRa的RE切PET-30a, 怎么也切不开,所以我 ...

如果只是切载体,你选的酶切位点是在多克隆位点处,双酶切也只是把载体切成线性分子,当然是一条带了,切下来的那一小段分子量很小,跑胶也看不到的。做双酶切时候要注意确保两个酶都切割比较完全,最好有单酶切的对照。判断是否切开质粒可以跑一个质粒对照。所提的质粒大部分以超螺旋形式存在,跑得比线性分子快。
4楼2012-10-31 08:16:02
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冰风颤木

金虫 (正式写手)

你这个载体双酶切应该就是一条带啊。。。。
船到桥头自然直
5楼2013-06-18 22:18:14
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