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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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zqt123_1981

木虫 (小有名气)

[交流] 基因全长克隆的问题 已有2人参与

GenBank里 一个全长基因，我要克隆做表达的话是克隆开放阅读框就行呢还是必须根据全长基因两头设计引物克隆呢？
全长序列如下红色为CDS
         1 cttcaccgtt atgaatacta cttctccacc atattccgac cctcacccgc tcgtatgcaa
       61 ttgggattcc ctgaatttgc ctgattctga tggaggcagc gaagagttga tgctggcctc
      121 cacacacccg aagaaacgag ctgggaggaa gaagtttcgg gagacgcggc accctgtgta
      181 ccgcggcgtg cggcggagga actccgggaa gtgggtatgc gaggtgaggg agcccaacaa
      241 gacgtccagg atatggctgg ggacgtttcc gacggcggag atggctgcgc gcgcgcacga
      301 cgtggcggca ttggcgctga ggggacgtgg ggcttgcctc aattttgcgg actctgcgtg
      361 gcggctgcat gtgcctagct cccgcgacgc caaggacatt cagaaggcgg cagcggaggc
      421 ggcggaggcg tttaggccaa tggagaatga tggggttatg caagatgaga ggagggaaga
      481 gagtgaggtg aggacgccgg ataatgtgtt ttttatggat gaggaggacg tttttggaat
      541 gccgggtctg ctggtgaata tggctgaggg tctgctgatg ccgccgccgc atagcgtggc
      601 ggatggctac ggtggagatg acatggcggc ggatgctgac atgtcgttat ggagttactc
      661 tatttagtaa ttagtctaaa gtaacagagg gtaggtggga gtttagtaga attaactatt
      721 agcccgtact tcattttttg gccagtacgg agatattaat atgtaagaaa aagtaagaga
      781 aaatcccaaa agtgggaggt aaatccggtg gttggtacgt ggcggttggc atgaagggat
      841 caaatggacc attccctaat aatatcgcca gcgagtgtgt ggaaagctac ggaaagagct
      901 tgtttcagct tttaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aa
//

[ Last edited by zqt123_1981 on 2012-10-9 at 14:17 ]
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1楼 2012-10-09 14:12:23
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碧海行帆

金虫 (初入文坛)
★
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CDS 为编码一段蛋白的序列
CDS 必定是一个ORF ，但orf不一定都是CDS。
以CDS为准应该没错
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硕士毕业去找工作
2楼2012-10-09 14:54:55
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xw19880905

新虫 (小有名气)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-10-09 15:50:03
主要看你的目的是什么，如果是做SNP的话，那就得做全场的了，如果是做基因表达的话，就可以只做能代表该基因的部分序列，特别是定量的话一般只需150bp左右。
赞一下 回复此楼
3楼2012-10-09 15:13:34
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