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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 请帮忙看看我的肝脏基因组提取的问题
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古韵清音

银虫 (小有名气)

[求助] 请帮忙看看我的肝脏基因组提取的问题

今天用肝癌和肺癌组织提取的基因组，左边四个条带很浅的是肺癌，右边两个很亮的是肺癌，上样量是5ul。
我的问题主要有两个：
1、用分光光度计检测浓度，第二个肝癌基因组的浓度是100多ug/ml，肺癌的浓度也是100多这个是怎么一回事，我觉得肝癌的明显没有100多，而肺癌的则不止100多。因为我下一步处理对基因组的量是有要求的，所以现在我拿不准应该依靠哪一个数据。
2、用的是qiagen的基因组提取试剂盒，操作全都是平行的。如果说是肝脏标本的问题，之前用这个标本提过RNA都没有问题，肺癌的也是提过RNA的，虽然冻融过两次，我觉得基因组应该比RNA要稳定很多吧。
是否提取肝脏的DNA有什么需要特别注意的地方呢？我也试了加RNA酶，完全没有影响诶

2012-09-13 genome liver c liver n lung 002c lung 002n.jpg
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1楼 2012-09-13 19:00:53
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tinyys

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
额，楼主你是不是应该把你问题中的 “肝” 和“肺”分清楚再提问啊？
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成长总是伴随一些无奈的
2楼2012-09-14 15:42:13
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古韵清音

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by tinyys at 2012-09-14 15:42:13
额，楼主你是不是应该把你问题中的 “肝” 和“肺”分清楚再提问啊？

对不起啊昨天感冒脑子是晕的。。。左边四个不亮的是肝癌，右边两个亮的是肺癌。
今天我看到有人说肝脏很容易裂解的，裂解时间不要太久，所以今天我缩短了裂解时间，结果平行做了四管，只有两管的质量还不错
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3楼2012-09-14 17:02:28
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jl860822

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
泳道里的样品感觉跑的不太好看，您试试重新跑一次，或者也有可能是您拍照的时候出了些状况，然后这个分光光度计的话，可能不太准，我觉得您应该相信胶上的吧，然后就是您的问题表述不太准确
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4楼2012-09-14 17:06:03
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古韵清音

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jl860822 at 2012-09-14 17:06:03
泳道里的样品感觉跑的不太好看，您试试重新跑一次，或者也有可能是您拍照的时候出了些状况，然后这个分光光度计的话，可能不太准，我觉得您应该相信胶上的吧，然后就是您的问题表述不太准确

好吧果然昨天脑子完全是晕菜的么。。。
现在主要问题就是，请问一下肝脏的DNA提取比起别的组织来有什么需要特别注意的么？我现在就是肝脏的DNA提出来质量不好，今天重新平行地提了四管，有两管质量还可以，但是另两管不行，所以现在提取肝脏DNA成了个运气问题。用的是qiagen的DNA提取试剂盒。我看有人说是肝脏RNA含量特别高所以对提取的DNA有影响，我对照着一管加了RNase一管没有加RNase，但是结果都是一样的，还是质量不好。
谢谢你啊
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5楼2012-09-14 23:30:53
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jl860822

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 古韵清音 at 2012-09-14 23:30:53
好吧果然昨天脑子完全是晕菜的么。。。
现在主要问题就是，请问一下肝脏的DNA提取比起别的组织来有什么需要特别注意的么？我现在就是肝脏的DNA提出来质量不好，今天重新平行地提了四管，有两管质量还可以，但 ...

这个你是不是可以考虑看看市面上有没有专门用来提取肝脏DNA的试剂盒，我没做过肝脏的，您可以问好点的生物公司问问
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6楼2012-09-15 21:11:14
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