24小时热门版块排行榜    

查看: 2715  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

chs4502

金虫 (小有名气)

[求助] 求助带酶切位点的引物设计

我想将我的目的片段连接到PYeS 2载体中,但是我的我的目的片段的GC含量很高,超过了60%。以cDNA为模版的PCR一直跑不出来。希望虫友们帮我设计一对带酶切位点的引物。MCS参照PYeS 2载体。
5端:ATGTGCCAGGGACAGGCAGTCCAGGGTCTGAGGCGCCGGAGTTCATTCTTGAAGCTC…………TGGCTACTGGCACCTATCGTGTGCTGCAGCGCCTGGCAGACGTGGCAGCTGAGGCCTAG3端。
PS:最后不要加保护碱基了,否则引物的Tm就要超标了。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

david0308

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-09-27 14:04:29
引物设计没有教科书上说的那么严格,这个完全可以自己设计,保护碱基一定要加的,否则是不能识别两端的酶切位点的,这个一定要记住。而且GC含量高也不要紧的,退火温度可以到60,如果P不出来的话还可以用高GC的PCR啊,有专门的高GC buffer,这个你可以自己查查。TM超标什么的都是浮云,做多了你就知道了,我还用过50多bp的primer做PCR呢,绝对可以的。
哈哈
4楼2012-09-27 13:47:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

review

银虫 (著名写手)

以其他的DNA为模板可以吗
交流
2楼2012-09-27 12:46:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

我也有相同的疑问。cDNA不行,什么模板可以做出PCR来?
3楼2012-09-27 13:12:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

houchm0927

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流经验 2012-09-28 14:42:04
具体理论不多说,说点自己做过的,仅供参考。设计引物时GC含量57-60%经常有,Tm60也做过,可以用。保护碱基曾有过没加的经历,没问题,有时加保护碱基也不是按理论上的碱基(当然别形成新的酶切位点),也没问题。总之,我跟人认为一般PCR引物设计没有那么严格。另外声明,我的模板都是质粒,不知道以cDNA为模板会如何。
5楼2012-09-27 20:42:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +8 Kittylucky 2026-08-27 8/400 2026-08-27 18:33 by raiy123
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 04:33 by Ie9AyIAvGbvs
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 02:01 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 怎么查啊 +5 huang1991js 2026-08-26 5/250 2026-08-26 16:09 by Equinoxhua
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +4 yuleib84 2026-08-26 5/250 2026-08-26 13:40 by yuleib84
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
信息提示
请填处理意见