24小时热门版块排行榜    

查看: 2721  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

chs4502

金虫 (小有名气)

[求助] 求助带酶切位点的引物设计

我想将我的目的片段连接到PYeS 2载体中,但是我的我的目的片段的GC含量很高,超过了60%。以cDNA为模版的PCR一直跑不出来。希望虫友们帮我设计一对带酶切位点的引物。MCS参照PYeS 2载体。
5端:ATGTGCCAGGGACAGGCAGTCCAGGGTCTGAGGCGCCGGAGTTCATTCTTGAAGCTC…………TGGCTACTGGCACCTATCGTGTGCTGCAGCGCCTGGCAGACGTGGCAGCTGAGGCCTAG3端。
PS:最后不要加保护碱基了,否则引物的Tm就要超标了。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

我也有相同的疑问。cDNA不行,什么模板可以做出PCR来?
3楼2012-09-27 13:12:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

review

银虫 (著名写手)

以其他的DNA为模板可以吗
交流
2楼2012-09-27 12:46:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

david0308

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-09-27 14:04:29
引物设计没有教科书上说的那么严格,这个完全可以自己设计,保护碱基一定要加的,否则是不能识别两端的酶切位点的,这个一定要记住。而且GC含量高也不要紧的,退火温度可以到60,如果P不出来的话还可以用高GC的PCR啊,有专门的高GC buffer,这个你可以自己查查。TM超标什么的都是浮云,做多了你就知道了,我还用过50多bp的primer做PCR呢,绝对可以的。
哈哈
4楼2012-09-27 13:47:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

houchm0927

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流经验 2012-09-28 14:42:04
具体理论不多说,说点自己做过的,仅供参考。设计引物时GC含量57-60%经常有,Tm60也做过,可以用。保护碱基曾有过没加的经历,没问题,有时加保护碱基也不是按理论上的碱基(当然别形成新的酶切位点),也没问题。总之,我跟人认为一般PCR引物设计没有那么严格。另外声明,我的模板都是质粒,不知道以cDNA为模板会如何。
5楼2012-09-27 20:42:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-30 22:24 by xiangy672
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +5 雨打竹帘 2026-08-30 9/450 2026-08-30 22:23 by 余韵清
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +4 349506619 2026-08-28 4/200 2026-08-29 22:41 by alongwaytogo
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金不中,共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
信息提示
请填处理意见