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请教一个PCR产物直接酶切的问题
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barrey
铁虫
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虫号: 285824
[交流]
请教一个PCR产物直接酶切的问题
本人最近做PCR产物直接酶切来验证某个基因SNP的差异,野生型中含有可以酶切的一个位点,突变型中不含有酶切位点,PCR反应用全式金的Eco Taq Mix扩增的,片段大小为859bp,见附图中的1,2,3,9,10泳道,限制性内切酶用的不常用的Hpy99I(NEB),PCR产物没有过柱回收,连续做了好几次,用野生型的PCR产物酶切后均没有任何条带,今天酶切条件是25uL体系,2U酶,加了BSA,以第10泳道的PCR产物5uL作为模板酶切(昨天分别做了10uL和15uL的模板浓度,均无酶切条带,所以推测不是模板浓度的问题),酶切结果在第十一泳道,什么条带都没有。
另外,由于该PCR产物中有单一的HindIII酶切位点,因此选择HindIII作为阳性对照,做了平行的酶切反应,酶切结果见泳道4-8.
请问导致这种现象的原因是什么,谢谢。
PCR产物酶切.jpg
[
Last edited by barrey on 2012-9-3 at 07:38
]
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2012-08-28 17:28:35
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zoelxx
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★
barrey(金币+1): 谢谢参与
如果是活力不高的酶,pcr产物应该纯化捏
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20楼
2012-08-30 08:35:02
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137167741
至尊木虫
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★ ★ ★ ★
barrey(金币+1): 谢谢参与
wizardfan: 金币+3, 很详细的回答
2012-08-29 05:24:01
第一、marker 多大?
第二、上样量多大?
第三、酶切之后的两条带都是多大?
第四、这个的不常用的Hpy99II (NEB)酶切效率怎样?与常见的HindIII相比。
第五、可以尝试一下柱回收。
~~~~
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2楼
2012-08-28 20:42:21
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zhoubaibin
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★
barrey(金币+1): 谢谢参与
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10楼
2012-08-29 06:23:20
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凤凰-涅磐
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barrey(金币+1): 谢谢参与
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12楼
2012-08-29 07:36:06
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liufuliang
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2012-08-28 22:00
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userhung
11楼
2012-08-29 07:09
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