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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 引物设计中遇到问题。求助。
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fengyunqb

新虫 (小有名气)

[求助] 引物设计中遇到问题。求助。

我克隆一个基因，找到的相近物种该蛋白的氨基酸序列比对设计简并引物，发现氨基酸序列保守性比较高。老师建议我找到核苷酸序列比对，用核苷酸序列设计引物。但是核苷酸序列长度不一，但CDS长度相差不大，能用CDS区序列比对设计引物吗？这样还是简并引物吗？核苷酸序列保守性就没氨基酸那么大了。该怎么去设计这个引物比较好？哪位虫子遇到过类视情况的指导下。万分感谢。
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1楼 2012-08-10 09:36:20
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fangni

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
fengyunqb: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-08-10 15:28:13
用CDS区设计引物就可以了，有时候没有必要用全长的
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3楼2012-08-10 09:52:50
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