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77638333

金虫 (著名写手)

[求助] 请问Real time q PCR一定要做融解曲线吗?

有没有具体的protocol?谢谢
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【分子生物】EPI帖

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tiani_tan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
77638333: 金币+1, ★★★很有帮助, 谢谢! 2012-08-03 13:35:26
根据你做qPCR采用的方法。染料法必须做融解曲线,主要是看的PCr产物是否特异,或者跑胶看看是否是特异扩增;如果用探针法或分子信标法的话,就不用了。
7楼2012-08-03 13:10:11
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
77638333: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢。qPCR参数已经有了。融解曲线的protocols能否详细一些? 2012-08-01 22:25:14
小丹木木: 金币+3, MolEPI+1, 鼓励积极热心的帮忙解答问题 2012-08-02 15:29:35
是的。溶解曲线是必须做的。
我们常用到的qPCR supplies 及用量(1个反应,20ul体系)如下,楼主可根据这个用量适量调整:
TBSYBRmix                 10 ul
PrimerF (10uM)           0.6 ul
PrimerFR (10uM)         0.6 ul
cDNA (20ng/ul)           2 ul
Reference dye             0.4 ul
ddH2O                        6.4 ul

PCR条件:
95度 1min
40x  95度 15s
       60度 45s
最后,melt curve
       95度 15s
       60度 45s
        95度 15s
可适当调整。
2楼2012-08-01 22:10:17
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


77638333: 金币+1, 有帮助, 谢谢! 2012-08-02 17:02:29
95度 15s
        60度 45s
         95度 15s
这个就是溶解曲线的PROTOCOL啊,当你的反应完成后,最后用上述步骤来考量是否你的所有PCR产物的TM值一致,如果一致,再检查反应效率等指标。如果不一致则需要调整条件或者换引物。
3楼2012-08-02 07:47:42
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lixc2009

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-08-02 15:29:49
77638333: 金币+1, 有帮助, 谢谢啦 2012-08-02 17:04:15
溶解曲线只是PCR仪的其中之一的功能,我在做PCR时有的会用到,有的不需要做,看你做什么实验。分享下我的PROTOCOLS:
预变性:  95℃    5min     *1
PCR    :  95℃    10s      
               60℃    15s      *50
               72℃    25s
HRM   :  95℃   1min
               40℃   1min      *1
               65℃    1s
               95℃    检测荧光
COOLING:    40℃     10S
希望对你有帮助!!
广州珈源--肿瘤检测、安博抗体,欢迎您!!
4楼2012-08-02 09:37:38
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