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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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wangmin2010

新虫 (小有名气)

[求助] 原核载体构建

求助:
    我现在在构建一个原核载体,是氯霉素抗性的,我用的是KpnI,XbaI这两个酶,我一直用的传统的方法,可就是连不上,PCR回收在酶切,质粒酶切,单酶切,都试过了,就是连不上,请问高手们,有没有遇到过这样的问题啊1
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自己的人生是要靠自己改变的!
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wangmin2010

新虫 (小有名气)

恩,在看呢,可是我还是找不到我的问题出在了什么地方?
自己的人生是要靠自己改变的!
2楼2012-07-31 19:59:47
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wangmin2010

新虫 (小有名气)

目的片段是1.4K,载体是3K,酶切回收后条带挺亮的,连接体系是10ul,各种比例都试过了,但板上什么都不长,
自己的人生是要靠自己改变的!
3楼2012-07-31 20:44:45
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tupac225

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
是不是感受态的问题,一般连不上就是这些问题。
coasttocoast。
4楼2012-07-31 21:00:09
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wangmin2010

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by tupac225 at 2012-07-31 21:00:09
是不是感受态的问题,一般连不上就是这些问题。

感受态是自己做的,转化质粒的话,能长满板子,挑了几个做鉴定,也都能提出质粒,可是转连接产物就什么也不长
自己的人生是要靠自己改变的!
5楼2012-07-31 21:31:57
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tupac225

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by wangmin2010 at 2012-07-31 21:31:57
感受态是自己做的,转化质粒的话,能长满板子,挑了几个做鉴定,也都能提出质粒,可是转连接产物就什么也不长...

我以前做的时候也遇到过这样地问题,看看连接的比例,一般载体和片段的比例为1:5到1:8,是摩尔质量比。
coasttocoast。
6楼2012-07-31 22:34:34
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酶切专家

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 还真是酶切专家哦,鼓励热心的虫虫 2012-08-01 13:44:18
克隆不成功最常见的原因是载体或PCR产物酶切不完全。
载体酶切时,最难得部分是如何判断载体是否完全酶切的方法,因为只有载体的完全双酶切,才能保证较高的克隆效率,减少假阳性。
一般来说,可以通过电泳分析来初步判断是否完全酶切:
1)如果你的载体上两个酶切位点间有一个较大的片段(大于300bp),那么一般通过电泳带型很容易判断出双酶切的效率,因为单切和双切后的载体大小是不一样的,而且还有酶切后产生的小片段提供参考。
2)如果你的载体上两个酶切位点很靠近,如大部分载体的多克隆位点序列。那么判断载体是否完全双酶切就比较麻烦。一般比较科学的方法是设置两种单酶切对照。即比照双酶切体系,分别进行实验所用的两种酶的单酶切,然后与双酶切样品同时进行电泳分析,注意,电泳时还需要设置未酶切的质粒对照。通过电泳的带型来判断在设定的酶切条件下(包括质量用量,buffer,酶的用量等),酶切是否完全。
3)而PCR产物的酶切效率通常很难判断,常用的电泳检测方法也不适用。但PCR产物的酶切还是有一些基本的原则,如:
A: 由于PCR产物的分子通产较载体分子小,因而在进行PCR产物酶切是,建议用较少的PCR产物(300-500ng)进行酶切,
B:而且通常PCR产物酶切时所用的酶量较载体酶切所需的酶量还要多(具体原因,可以参考各种限制性内切酶的单位定义)。

事实上,由于限制性内切酶单位定义的特殊性,不同的酶在实际使用时,所需的用量差别较大(如XbaI的用量就应该比KpnI多10倍左右)。建议你使用一些能够精确计算酶切时限制性内切酶用量的软件计算,确保载体和PCR酶切的完全和彻底。我在小木虫上推荐过一个软件(double digestion designer),你可以试一试
7楼2012-08-01 00:01:57
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wangmin2010

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by tupac225 at 2012-07-31 22:34:34
我以前做的时候也遇到过这样地问题,看看连接的比例,一般载体和片段的比例为1:5到1:8,是摩尔质量比。...

我是胶回收后跑电泳,根据条带估计值,然后按1:3的比例连的,比如载体25ng/ul,目的片段是30ng/ul,我做的10ul连接体系:
载体:4ul
目的片段:4.5ul
连接酶:0.5ul
buffer:1ul
构建这个载体已经挺长时间了,各种比例差不多都试过,不知道这那样算摩尔质量比对吗?
自己的人生是要靠自己改变的!
8楼2012-08-01 18:58:33
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wangmin2010

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 酶切专家 at 2012-08-01 00:01:57
克隆不成功最常见的原因是载体或PCR产物酶切不完全。
载体酶切时,最难得部分是如何判断载体是否完全酶切的方法,因为只有载体的完全双酶切,才能保证较高的克隆效率,减少假阳性。
一般来说,可以通过电泳分析来 ...

谢谢,我试试吧,之前我试过分部酶切,先用KpnI切四个小时,然后回收,在用XbaI酶切三个小时回收,然后在做连接,可是还是失败。
自己的人生是要靠自己改变的!
9楼2012-08-01 19:02:01
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84146922

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励热心积极交流 2012-08-02 15:39:52
个人有些想法:
1.先确保载体被切开,分别用你的两种酶单酶切,双酶切,然后跑胶,没有问题再往下做。
2.再确认下酶的说明书,PCR产物有些要求,是要切久一点的,不过,你切4h,应该够了。回收后的效率如何,PCR产物有多大?胶回收试剂盒的分辨率可以达到吗?
3.确保连接酶没有问题,我就试过一次连接酶坏了,做几次都没有出来。连接体系中,载体与目的片段如何?
4.确认感受态木有问题.
希望对你有帮助!
10楼2012-08-01 19:59:15
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