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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 动植物 » 综合其他 » 转录组数据怎么分析
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nonglong1

金虫 (正式写手)

[交流] 转录组数据怎么分析

有没有做过转录组的高手，当拿到转录组数据后怎么筛选想要克隆的基因，另外这些名次具有什么参考价值呢？谢谢
geneID        geneLength       
Nr-ID        Nr-Score        Nr-Evalue          
Nr-annotation       Swissprot-ID       
Swissprot-Score        Swissprot-Evalue        Swissprot-annotation
COG-Protein-or-Domain        COG-Score        COG-Evalue        COG-ID        COG-Function-Description       
KO_id        KEGG-Evalue        KEGG-Score        KEGG-Gene        ko_definition        GO-BiologicalProcess        GO-MolecularFunction       
             Go-CellularComponent
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1楼2012-07-27 13:03:09
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nonglong1

金虫 (正式写手)
怎么这么久都没有人回复啊？
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2楼2012-08-07 19:56:47
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magy2006

木虫 (著名写手)
不懂，帮你顶……
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3楼2012-10-10 14:30:42
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fallout76

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
4楼2012-12-11 11:07:44
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jackplane

铁虫 (小有名气)
找你导师吧，
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6楼2012-12-12 21:34:14
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小小树虫

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
转录组数据不好整， 听过几次报告 有的还要写编程
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7楼2012-12-13 15:54:50
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yangsh_nj

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
需要看你的实验目的及具体的实验设计。看来又是一个被忽悠直接去测转录组的实验室。中国人钱多啊，没办法。
赞一下 回复此楼
9楼2012-12-16 17:04:43
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nonglong1

金虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by yangsh_nj at 2012-12-16 17:04:43
需要看你的实验目的及具体的实验设计。看来又是一个被忽悠直接去测转录组的实验室。中国人钱多啊，没办法。

目前得到序列信息后就是做基因克隆。请问还可以做什么没有？
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10楼2013-02-28 13:10:27
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nonglong1

金虫 (正式写手)
请问怎么测植物体内游离的NH4+? 有什么简单准确的方法么？
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11楼2013-02-28 13:17:57
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cbiology

铜虫 (正式写手)
同问
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12楼2014-09-02 22:36:49
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shucanwei

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by jackplane at 2012-12-12 21:34:14
找你导师吧，

不靠谱
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13楼2014-12-29 22:31:29
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su-b085楼
2012-12-11 14:14   回复  
su-b088楼
2012-12-15 19:09   回复  
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