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soffy0214

铜虫 (小有名气)

[求助] 植物RNA提取电泳图,求解析!

植物RNA提取电泳图,求解析!提了很长时间,不是多条带就是边缘模糊带,不知道是降解还是电泳条件和胶没制好?以前我用氯仿只抽提一次,发现带很亮,而且有五条,后来就用氯仿抽提两次,出现三条带,可是边缘模糊。好像我一直以来跑的电泳带都是比较模糊的,不知道是什么原因?


[ Last edited by soffy0214 on 2012-7-10 at 21:54 ]
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lele1983

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
正常就应该是3条带,前两条亮,最下面一条比较弱,条带模糊,可能是因为电泳时间过长,RNA有部分降解,要么是含有杂质。
2楼2012-07-10 22:29:08
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xiaozhuhome

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+5, 鼓励积极应助,解答问题 2012-07-13 16:16:00
soffy0214: 金币+2, ★★★★★最佳答案 2012-07-13 19:32:59
看你的电泳结果,RNA没有问题的。感觉是电泳跑的不太好条带模糊。像是电泳液缓冲能力不太好,不知道是不是电泳液不新鲜导致。另外,你所说的5条带这里没有图就看不出来到底是怎么回事。RNA只要不降解,做一般实验是没有问题的。你的胶看起来是普通的胶,没有加变性剂,加入变性剂后,很容易看到28S是18S的两倍的关系,更加可以确定没有降解发生。如果实在不放心,可以再测一下OG,260/280如果在1.8到2.0之间就没有问题。超过2.0说明还是有降解。还有就是据我个人的经验,植物组织RNA不需要多次用氯仿抽提,因为氯仿在这里的作用,一个是去除痕量酚,另外要去除脂质,第三个作用就是增大有机相的比重,在实验中没有意外发生,抽提一次足矣。希望对你有帮助
3楼2012-07-13 10:16:31
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dingxiuying

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励交流经验 2012-07-13 16:16:11
我跑过的RNA三条带或五条带的都有,因为组织中有叶绿体或线粒体的RNA也被提取出来了。不论几条带,判断标准是一样的,只要28S和18s两条带比较清晰,且亮度比接近1:1或2:1,而最小的5s比较弱的话,说明RNA提取质量还可以,再配合OD值来判断,就能确定RNA是否可用于后续试验。
楼主的电泳极有可能是胶的问题,建议重新配制电泳buffer和胶试试。另外,RNA电泳不能跑太长时间,指示剂移出加样孔大约2-3cm就可以看胶了,时间太长容易模糊,电压不能太大,4-5V/cm胶长就行。
我喜欢默默地被你注视默默地注视着你,我喜欢深深地被你爱着深深地爱着你
4楼2012-07-13 14:02:42
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