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wangcongxs

银虫 (著名写手)

[求助] PCR不出带,求教

我用酶切连接后的产物进行预扩增,退火温度度降到48度才有目的带(引物TM值一条55.75,一条52.18),然后把预扩增产物稀释10倍进行选扩增,跑6%的变性PAGE,PCR25ul的体系,buffer2.5ul,镁离子1.5,DNTP1.0,引物(10uM)1.5,rTaq0.3,PCR程序用touchdown,从65降至56。我用的是我们老师做的体系,只是模板不一样,可是物种是一样的,为什么一直扩不出带啊,难道预扩就是假阳性?但是退火温度高了只有弥散啊,请各位朋友帮忙提提意见……不胜感激!
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

个人建议你讲预扩增产物稀释50倍后用试试,另外根据引物算出的Tm值,建议你的touch down程序温度变为从60-51或者更低。
5楼2012-07-17 09:02:01
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
wangcongxs: 金币+2 2012-07-19 09:08:23
引用回帖:
8楼: Originally posted by wangcongxs at 2012-07-18 10:42:03
要稀释那么多吗?我以前稀释10倍、20倍25的体系家5微升,现在我直接用原液1微升.我昨天用touchdown退火温度从60-48,然后55度扩增的有带,但主要在1500bp以上,我发现做甲基化的很多文章选扩都是用的一模一样的程序 ...

一般Tm值算出后下调5-10度为宜
10楼2012-07-18 11:01:10
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