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870609

金虫 (小有名气)


[交流] MD程序升温这一步大家一般都跑多少,进来交流一下

最近在用ds分布跑分子动力学,做到heating or cooling这一步时,以0.001ps为步长,总共100000步计算3天报错,显示unknown error,不知是什么地方出了问题,请各位指正,谢谢。还想向大家请教,一般在做这步计算的时候,计算多大步长和总时间合适?谢谢
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851086861

铜虫 (初入文坛)



870609(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
6楼: Originally posted by zhouzhiguang at 2012-11-03 15:31:15
我想问一下您,DS分部跑的时候如果出现error :CHARMm does not finish successfully.这个是怎么回事的啊?

请问您解决了吗,我也遇到了同样的问题
7楼2022-08-13 17:51:05
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rush7

金虫 (小有名气)



870609(金币+1): 谢谢参与
我用lammps,可能不大一样,十几万的体系3万步就OK了。能量稳定了就行呗
2楼2012-06-28 20:41:32
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870609

金虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by rush7 at 2012-06-28 20:41:32
我用lammps,可能不大一样,十几万的体系3万步就OK了。能量稳定了就行呗

温度是从50k升到300k么?请问你做的时候步长是多少?也是0.001ps吗?谢谢
3楼2012-06-29 07:05:38
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rush7

金虫 (小有名气)



chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-06-29 17:30:25
引用回帖:
3楼: Originally posted by 870609 at 2012-06-29 07:05:38
温度是从50k升到300k么?请问你做的时候步长是多少?也是0.001ps吗?谢谢...

步长和材料有关系啊 可比性也不大~
4楼2012-06-29 12:41:30
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