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MD程序升温这一步大家一般都跑多少,进来交流一下
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870609
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[交流]
MD程序升温这一步大家一般都跑多少,进来交流一下
最近在用ds分布跑分子动力学,做到heating or cooling这一步时,以0.001ps为步长,总共100000步计算3天报错,显示unknown error,不知是什么地方出了问题,请各位指正,谢谢。还想向大家请教,一般在做这步计算的时候,计算多大步长和总时间合适?谢谢
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2012-06-28 16:14:05
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chen_kg
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2012-06-29 17:30:34
对有的带缺陷的结构来说,弛豫时间过长,确实会导致结构崩溃。我一般是共轭梯度法将能量最小化后升温到结构熔点的70%,再冷却以获得稳定结构。哪怕是上千万个原子的金属结构,这个过程也不会超过8W步。
一般来说,弛豫过程的时间大概是2*弹性波在结构最长方向的传播时间。
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2012-06-29 17:05:23
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870609(金币+1): 谢谢参与
我用lammps,可能不大一样,十几万的体系3万步就OK了。能量稳定了就行呗
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2012-06-28 20:41:32
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2楼
:
Originally posted by
rush7
at 2012-06-28 20:41:32
我用lammps,可能不大一样,十几万的体系3万步就OK了。能量稳定了就行呗
温度是从50k升到300k么?请问你做的时候步长是多少?也是0.001ps吗?谢谢
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3楼
2012-06-29 07:05:38
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rush7
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3楼
:
Originally posted by
870609
at 2012-06-29 07:05:38
温度是从50k升到300k么?请问你做的时候步长是多少?也是0.001ps吗?谢谢...
步长和材料有关系啊 可比性也不大~
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4楼
2012-06-29 12:41:30
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