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hyyws

木虫 (正式写手)

[求助] 酿酒酵母基因敲除转化问题

最近在做工业酿酒酵母基因敲除实验,使用的是自己筛选的单倍体菌株,转化A+KanMX+B这个片段进入酿酒酵母基因组(A,B片段分别是酿酒酵母X基因外部上下游同源区),得到X基因缺失的转化子。重组后一方面将KanMX基因引入酵母染色体,使重组菌株产生G418抗性;另一方面,KanMX片段同源重组替换了酵母染色体上的X基因,从而实现该基因的敲除。
碰到的问题是:电转后长出大片的菌落,且菌落很小,挑液体培养基培养却不长。已经多次出现这种问题,调整了电击的压力最后选择了2kv,也做过转化片段的浓度,转过3ug,5ug,都能长,但都是挑出来液体就不长!固体平板和液体培养基的G418含量都是200mg/ml。
望虫友们不吝赐教。
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caoluoyuan

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
hyyws: 金币+15, ★★★很有帮助, 谢谢指教。 2012-06-12 15:23:32
对于工业酿酒酵母电转化并不是好方法,醋酸锂转化法效果不错,可以试试看,另外平板G418浓度加倍试试看
2楼2012-06-12 11:25:03
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stlion223

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助,欢迎交流 2012-06-12 15:13:03
hyyws: 金币+20, ★★★很有帮助, 谢谢指导。马上着手试试! 2012-06-12 15:22:40
大片很小的菌落就是转化不成功的表现 成功的整合Colony会长很大 做integration的时候会出现这样的情况

同意2楼 电转和热转都试一下 虽然一般情况下线性DNA电转要好一点

recover了多久?可以尝试先recover 4个小时,涂一批;4小时后加0.2g/ml G418 然后 recover过夜 再涂一批

DNA的量确实需要比较多 一般lab strain用KanMX做敲除我用1ug 涂1/3 有不到10个CFU 做Delta integration的时候 我回用到20ug 如果工业yeast不好转的话 不妨多用一些
那么多的玻璃鞋很多人适合没有独一无二
3楼2012-06-12 12:03:55
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