24小时热门版块排行榜    

查看: 1856  |  回复: 4
【悬赏金币】回答本帖问题,作者xianzhaozhao将赠送您 10 个金币

xianzhaozhao

木虫 (小有名气)

[求助] 脾脏总RNA提取及RT-PCR

第一次接触分子试验,不顺利,说出来请大家帮忙指点一下。
我试验的目的是牛akirin 2基因克隆与表达。具体操作如下:
1,去宰牛场等着采牛脾,牛从放血后经剥皮到脾脏采出大概50分钟,拿到脾脏后用剪刀剪碎,锡箔纸包裹,迅速放于液氮中。
2.用天根 Trizol A+ 试剂盒提取脾脏总RNA,取出脾脏后敲碎,取一小块在玻璃匀浆器中加trizol匀浆,在冰上,另一种方法是加Trizol ,用电动匀浆器匀浆,其余步骤按照试剂盒步骤操作,获得总RNA。
3.将电泳槽清洗H2O2处理,让后用DEPC水处理,电泳液和胶都是DEPC处理水新配,1%的胶,电压110,时间15分钟。结果如图,貌似有两条很浅的条带,,猜测可能是rna,但是最前边有很个亮疙瘩,是不是降解了。
4.用天根的试剂盒合成CDNA第一链。
5.然后进行PCR,上游引物:5' GAATTCGTGGAAGAGTCAGACAGTGCAGG 3'
下游引物:5' GGATCCTTGGAATCAGAACTCAGTTTATG 3'
退火温度试过60,58,55,都没有目标条带出来。
我得叙述是否清楚,该实验如何进行试验改进,问题出现在哪里?请各位不吝赐教,不胜感激。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xianzhaozhao

木虫 (小有名气)

有没有高人指点一下。多谢!
2楼2012-05-17 07:13:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

longrna

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助,很热心哦 2012-05-17 14:29:55
RNA提取应该没什么问题。你所说的浅浅的两条带是28S\18S,最亮那条是5S。并没有很明显的降解。如有条件可测Agilent 2100看一下午RIN 值。

有两点未能确定:
1、牛脾脏RNA是否5S含量特别多。如脾脏里5S的确那么多而你又不需要那么多的5S,可以用硅胶柱结合的方式来提取-得到的5S会比异丙醇沉淀少。不过柱子纯化费用要稍高。
2、天根的kit效果能达到什么程度。
伟大航线....
3楼2012-05-17 09:16:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

longrna

新虫 (正式写手)

另外不排除是你电泳跑的不好的原因。在marker或样品的边缘好像有一些痕迹,不知是有蛋白污染还是胶的问题,重跑或测Agilent吧
伟大航线....
4楼2012-05-17 09:18:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xianzhaozhao

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by longrna at 2012-05-17 09:18:34:
另外不排除是你电泳跑的不好的原因。在marker或样品的边缘好像有一些痕迹,不知是有蛋白污染还是胶的问题,重跑或测Agilent吧

感谢指点,
我不太确定牛脾脏RNA5S含量特别多,您知道有什么方法可以确定吗?
RNA 和CDNA都是用天根试剂盒做的,如果这两步问题不大的话,那么怎么调整PCR程序,请再指导一下。
5楼2012-05-19 07:19:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xianzhaozhao 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 求助!请问海外博后依托内地单位申请青基的优劣? 100+3 2280999712 2024-11-15 9/450 2024-11-15 23:08 by dxcharlary
[论文投稿] 国内期刊审稿人数量 +3 新时代核动力驴 2024-11-13 5/250 2024-11-15 20:37 by 新时代核动力驴
[考博] 中南大学 粉末冶金国家重点实验室 陈超教授课题组拟招收 1~2位博士研究生通知 +7 中南大学-金属材 2024-11-14 18/900 2024-11-15 20:22 by 中南大学-金属材
[论文投稿] angew三个小修,返修过去已经20多天了没动静,有朋友遇到这种情况吗? +5 迟迟未到场 2024-11-14 5/250 2024-11-15 20:16 by 秦时明月zy
[论文投稿] 小论文影响大论文查重吗? +3 阿道夫深度 2024-11-14 4/200 2024-11-15 16:19 by sugarmei
[教师之家] 大学老师 +11 考研一路顺风 2024-11-13 14/700 2024-11-15 15:24 by LNP@mRNA
[基金申请] 变性人申请基金咋算性别? +21 leicahfs 2024-11-11 21/1050 2024-11-15 14:54 by 跳鱼拨刺
[基金申请] 博后资助名单出来了 +12 Shxjjxjkx 2024-11-14 14/700 2024-11-15 14:40 by fanfenggui
[基金申请] 求助 +4 Enenenene 2024-11-15 4/200 2024-11-15 09:36 by 榨菜拌青椒
[基金申请] 博后基金分组排名 +7 攻城2025 2024-11-14 7/350 2024-11-14 21:19 by 实验小白ha
[论文投稿] 投稿系统中的通讯作者和文章中的通讯作者不一样,文章目前被录用了? +4 babybabygo 2024-11-12 5/250 2024-11-14 19:13 by 走了002
[硕博家园] 大龄已婚想读博如何 +15 米娅阳 2024-11-11 18/900 2024-11-14 14:18 by xiaomi0401
[找工作] 咨询一下江西的高校待遇,人文氛围怎么样? +5 akslis2024 2024-11-09 5/250 2024-11-14 13:53 by 啄木鸟、
[基金申请] 76批博后基金 +3 feiyi3986 2024-11-14 3/150 2024-11-14 11:50 by puly
[有机交流] 硫谜用双氧水氧化出现的困惑(老板说一定要用双氧水氧化做好)求指教 10+4 luowenwu 2024-11-10 15/750 2024-11-14 10:52 by luolinfeng
[基金申请] 博后面上出结果了 +5 wl87925139 2024-11-14 5/250 2024-11-14 10:26 by kingmax18996
[论文投稿] 二审审一年的佛系编辑 +10 thefoxrain 2024-11-09 15/750 2024-11-12 19:27 by lide966
[论文投稿] 爱思唯尔投稿系统里的通讯作者可以和文章里的通讯作者标注不同吗 +7 Omnissiah 2024-11-10 7/350 2024-11-12 14:07 by holypower
[有机交流] 求助NMR +5 苯巴比妥! 2024-11-09 5/250 2024-11-12 11:20 by 88817753
[基金申请] 要求论文发表日期在项目执行期内,论文发表日期是在线日期还是见刊日期 +6 Jiangnanyu1 2024-11-09 7/350 2024-11-10 17:49 by jurkat.1640
信息提示
请填处理意见