应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 关于系统进化树构建方法的求助
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 4055  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

第五平原

木虫 (正式写手)

[求助] 关于系统进化树构建方法的求助

我想针对不同物种的某一个基因的蛋白序列用MAGE4做一个系统进化树分析，构建时是邻接法呢还是用极大似然法呢？哪个更准确一点？小白求助。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
勤勉
1楼 2012-03-22 15:52:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qjzhihua

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by rommel1941 at 2012-03-22 22:46:25
NJ和ML树本身算法有差异，具体很复杂，如果你要是构建树的话，最好将几种方法都做一下，针对你的研究方向，看看他们之间的差异。NJ法要求要有一个较好的外群，这个需要你自己摸索。分析中的参数基本可以从Modeltest ...

你好，请问一下你说的外群，是指什么呢？我做一个菌株的蛋白序列的进化树，那选择这个外群是在这个菌株里面选择一个与他毫无关系的蛋白好呢？还是在其他菌株里面选择一个与他毫无关系的蛋白好呢？
赞一下 回复此楼
8楼2015-09-08 10:29:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
NJ和ML树本身算法有差异，具体很复杂，如果你要是构建树的话，最好将几种方法都做一下，针对你的研究方向，看看他们之间的差异。NJ法要求要有一个较好的外群，这个需要你自己摸索。分析中的参数基本可以从Modeltest和Mrmodeltest中获得。祝好
赞一下 回复此楼
将相本无种★男儿当自强
2楼2012-03-22 22:46:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

第五平原

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by rommel1941 at 2012-03-22 22:46:25:
NJ和ML树本身算法有差异，具体很复杂，如果你要是构建树的话，最好将几种方法都做一下，针对你的研究方向，看看他们之间的差异。NJ法要求要有一个较好的外群，这个需要你自己摸索。分析中的参数基本可以从Modelte ...

非常感谢，顺便再问一句，如果我用几种方法都试了，最符合植物学分类的那一个图是不是就算最准确的那一个啊？
赞一下 回复此楼
勤勉
3楼2012-03-23 10:55:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiesenyuli

金虫 (小有名气)
我用mega5.0构建，但是一导入进菌种基因序列很慢，然后点击W后计算特别慢，最后也没成功。是不是软件问题还是怎么回事？我导入了20个菌株序列
赞一下 回复此楼
4楼2012-03-23 14:35:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 275求调剂 +12 waltzh 2026-04-01 12/600 2026-04-01 21:44 by chyhaha
[考研] 292求调剂 +17 木虫er12138 2026-04-01 17/850 2026-04-01 21:37 by 七度不信任
[考研] 303分 0807学硕求调剂 +3 TYC3632 2026-04-01 3/150 2026-04-01 19:24 by lwk2004
[考研] 生物与医药考研调剂 +5 铁憨憨123425 2026-03-31 5/250 2026-04-01 18:01 by syh9288
[考研] 349求调剂 +6 吃的不少 2026-04-01 6/300 2026-04-01 17:55 by JYD2011
[考研] 调剂 +3 好好读书。 2026-04-01 5/250 2026-04-01 15:39 by 好好读书。
[考研] 291求调剂 +3 迷蒙木木 2026-04-01 4/200 2026-04-01 11:07 by 逆水乘风
[考研] 282求调剂 +6 呼吸都是减肥 2026-04-01 6/300 2026-04-01 08:58 by laoshidan
[考研] 086000调剂 +5 7901117076 2026-03-26 5/250 2026-03-31 17:45 by 544594351
[考研] 286求调剂 +6 Faune 2026-03-30 6/300 2026-03-31 14:37 by jp9609
[考研] 英一数一总分334求调剂 +4 陈阳坤 2026-03-31 4/200 2026-03-31 14:22 by 记事本2026
[考研] 266求调剂 +3 哇呼哼呼哼 2026-03-29 3/150 2026-03-31 10:06 by cal0306
[考研] 0703化学321分求调剂 +10 三dd. 2026-03-30 11/550 2026-03-30 19:24 by markhwc
[考研] 材料专硕 085600求调剂 +7 BBQ233 2026-03-30 7/350 2026-03-30 17:44 by oooqiao
[考研] 0703 化学 求调剂，一志愿山东大学 342 分 +7 Shern—- 2026-03-28 7/350 2026-03-30 16:31 by nothing投稿中
[考研] 085701求调剂初试286分 +5 secret0328 2026-03-28 5/250 2026-03-30 12:54 by fangnagu
[考研] 一志愿中南大学化学0703总分337求调剂 +6 niko- 2026-03-27 6/300 2026-03-30 10:25 by herarysara
[考研] 343求调剂 +6 爱羁绊 2026-03-29 6/300 2026-03-29 12:00 by 无际的草原
[考研] 求佛 +7 迷人的哈哈 2026-03-28 7/350 2026-03-28 16:47 by 催化大白
[考研] 305求调剂 +5 哇卢卡库 2026-03-26 5/250 2026-03-27 14:01 by laoshidan
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭