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荧光PCR中,荧光阀值的问题
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liwanghua251
金虫
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[交流]
荧光PCR中,荧光阀值的问题
我做相对定量,什么时候需要手动设置阀值?
做了两板PCR,怎么才能一起分析相对定量。例如,一个板子上是0h,12h,24h,36h。另一板上是0h,48h,60h,72h.想把他们同一起来比较,得出不同时间段的表达差异。
是否需要把两板中的0h,的Ct值调成一致。
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2012-03-14 09:17:49
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小猫三两只
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5楼
:
Originally posted by
liwanghua251
at 2012-03-16 12:20:24:
可能不可能是引物二聚体。
阴性对照没有模板,只有引物,怎么会有带?所以不会是引物二聚体,应该是你的体系污染。如果你的样品扩增过程 中出现了另外的峰,则要么是非特异性扩增,要么是引物二聚体
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8楼
2012-03-16 16:47:00
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西瓜
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2012-03-15 09:05:59
1949stone: 金币+1, 鼓励
2012-03-15 09:58:29
不用调阈值的,调了也没意义。阈值虽然能影响CT值,但是不能影响Ct值的差异(前提是阈值设置在合理范围)。
你两个板的不同时间点的样品分别和同一个板上的0h比较,两个板的结果可以放在一起,不过严谨的做法应该是所有样品都在同一个板上跑。
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2楼
2012-03-14 22:43:50
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liwanghua251
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楼
:
Originally posted by
西瓜
at 2012-03-14 22:43:50:
不用调阈值的,调了也没意义。阈值虽然能影响CT值,但是不能影响Ct值的差异(前提是阈值设置在合理范围)。
你两个板的不同时间点的样品分别和同一个板上的0h比较,两个板的结果可以放在一起,不过严谨的做法应该 ...
我也知道严谨的做法,但是实在是没法放在一起。是不是说一般的阀值都不用改,按照机器给的就可以了吗?
还有个问题就是,阴性对照的作用是什么?我做的阴性对照也有峰怎么回事?
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3楼
2012-03-15 09:05:48
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3楼
:
Originally posted by
liwanghua251
at 2012-03-15 09:05:48:
我也知道严谨的做法,但是实在是没法放在一起。是不是说一般的阀值都不用改,按照机器给的就可以了吗?
还有个问题就是,阴性对照的作用是什么?我做的阴性对照也有峰怎么回事?
一般做 荧光定量的话都不用调阀值的,按机器默认的就行。阴性对照有峰说明你的体系可能有污染
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4楼
2012-03-15 17:49:10
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