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张晓梅ZXM

金虫 (正式写手)

meimeizhang

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[求助] 为何PCR产物测序只测一部分？

想做一些看家基因分析，文献给的扩增引物和测序引物信息（位点）结果如下：
F:1162-1190 R:2126-2155 扩增产物994bp
F1:1273-1291 R1:2135-2152 测序产物879bp 实际测得540bp

问题一：为何测序只测PCR扩出来的一部分？如果本来只需这一小段的话为何不直接扩这一段？

问题二：根据测序引物的位点推测产物应该是879bp,为何实际测序结果是540bp?

很困惑，请教大虾！感激不尽！

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每天进步一点点，持之以恒！

1楼 2012-02-22 23:06:29

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张晓梅ZXM

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引用回帖:

7楼: Originally posted by 若水5886 at 2012-02-23 16:15:34:
我不知道文献具体说的是什么情况，我是不是可以理解为文献说的目标序列其实是500多呢？测序的时候前后有部分序列不是目标序列的哦，比如说有一部分是载体序列，或者有一部分是测序引物和目标序列之间的序列。简言 ...

800多是我根据测序引物推的，500多是它给的结果，你的说法应该是对的，800多当中只有500多是目的序列