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niuxiaoqi721铜虫 (小有名气)
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过渡态消除虚频
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| 过渡态收索出来以后，发现有两个虚频。一个一千多，一个一百多，怎样才能消除小的那个，看到有人用要消除的虚频*0.1-0.3加到原来的坐标上，可是不知道具体操作步骤，这里请高人指导，越详细越好。万分感谢，还有就是本人使用的是Dmol |
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 过渡态计算 |
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gongxd325
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2楼2012-02-20 13:50:40
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5楼2012-02-21 08:58:46
【答案】应助回帖
liliangfang(金币+2): 多谢回帖交流 2012-02-21 11:07:04
| 差别大并不能说明有问题，关键是看优化完了，是否满足唯一虚频，且其振动由反应物指向产物。我觉得你完全可以试试TS optimization，坦率地说，消虚频没有什么特别好的方法，都是按照其振动方式微调原子位置，TS optimization也基本就是这个原理，所以说某种方法更准确没什么太多道理，而且，TS optimization还方便，过渡态的优化还不比结构优化，后者是要把所有的虚频模都消掉，而过渡态还得保留你需要的虚频模，所以调整起来更麻烦。此外，过渡态结构唯一吗？算出来的唯一虚频模的频率是负1000波数，合理，如果稍微调整一下原子位置，变成负500波数也完全可能，按照我们目前判断过渡态的依据，两者都合理。 |
6楼2012-02-21 10:13:34
7楼2012-02-22 10:34:40
niuxiaoqi721
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8楼2012-02-23 09:53:27
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