应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 过渡态消除虚频
51/1返回列表
查看: 5143  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

niuxiaoqi721

铜虫 (小有名气)

[求助] 过渡态消除虚频

过渡态收索出来以后，发现有两个虚频。一个一千多，一个一百多，怎样才能消除小的那个，看到有人用要消除的虚频*0.1-0.3加到原来的坐标上，可是不知道具体操作步骤，这里请高人指导，越详细越好。万分感谢，还有就是本人使用的是Dmol
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

过渡态计算

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
加油
1楼 2012-02-20 11:23:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

niuxiaoqi721

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by yadong80 at 2012-02-20 22:47:47:
你有用过TS optimization吗？这个功能就是解决你这个问题的，消除多余的虚频模，原理和二楼说的小工具差不多，只不过在MS里面自动完成了。DMol3默认情况下会自动选择频率最低的模作为由反应物指向产物的振动模，保 ...

可是有人说过渡态优化不准确，有时候优化出来的结构与原来的结构差别很大
赞一下 回复此楼
加油
5楼2012-02-21 08:58:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

gongxd325

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
liliangfang(金币+1): 多谢指教 2012-02-20 15:04:11
论坛里有消虚频用的小软件，不过是针对Gaussian的结构，原理一样的，就是把结构稍作改动，把原来有虚频的结构对应的坐标增大或减小点（最好是观察虚频对应的振动模式后决定如何改变坐标）
赞一下(3人) 回复此楼
一个人做点好事并不难难的是一辈子做好事!!!
2楼2012-02-20 13:50:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoboy185

金虫 (正式写手)
franch(金币+2): 谢谢回帖交流。。。。 2012-02-20 21:28:01
dmol这个找过渡态感觉不太靠谱啊
最好还是用vasp吧
赞一下 回复此楼
3楼2012-02-20 19:13:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yadong80

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
WDD880227(金币+2): 感谢交流，有帮助 2012-02-21 08:37:09
你有用过TS optimization吗？这个功能就是解决你这个问题的，消除多余的虚频模，原理和二楼说的小工具差不多，只不过在MS里面自动完成了。DMol3默认情况下会自动选择频率最低的模作为由反应物指向产物的振动模，保留下来，而将其他的虚频模优化掉，当然，你也可以自己添加Key words：Opt_TS_Mode，选择需要保留的模，也就是你认为由反应物指向产物的振动模，这个模可以不是频率最低的模，譬如你提到的频率是负几十个波数的模。
赞一下 回复此楼
4楼2012-02-20 22:47:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 药学383 求调剂 +3 药学chy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 20:51 by 元子^0^
[考研] 085601求调剂 +3 Du.11 2026-03-16 3/150 2026-03-16 20:42 by 无际的草原
[考研] 考研化学学硕调剂，一志愿985 +3 张vvvv 2026-03-15 5/250 2026-03-16 20:25 by 张vvvv
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
[考研] 一志愿211 0703方向310分求调剂 +3 努力奋斗112 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:44 by houyaoxu
[考研] 285求调剂 +6 ytter 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:05 by njzyff
[考研] 304求调剂 +6 小熊joy 2026-03-14 6/300 2026-03-16 12:59 by Iveryant
[考研] 0703化学调剂 290分有科研经历，论文在投 +7 腻腻gk 2026-03-14 7/350 2026-03-16 10:12 by houyaoxu
[考研] 290求调剂 +5 孔志浩 2026-03-12 10/500 2026-03-16 09:01 by 余晖&
[考研] 070305求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-14 4/200 2026-03-15 11:04 by peike
[考研] 材料工程327求调剂 +3 xiaohe12w 2026-03-11 3/150 2026-03-14 20:20 by ms629
[基金申请] 面上和青基一样限30页不合理 +5 wowsunflower 2026-03-10 7/350 2026-03-14 17:21 by kingkocxr
[考研] 材料与化工（0856）304求B区调剂 +7 邱gl 2026-03-10 11/550 2026-03-14 12:18 by 邱gl
[考研] 材料专硕288分求调剂 一志愿211 +4 在家想你 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:49 by JourneyLucky
[考研] 285化工学硕求调剂（081700） +6 柴郡猫_ 2026-03-12 6/300 2026-03-13 20:46 by hmn_wj
[硕博家园] 085600 260分求调剂 +3 天空还下雨么 2026-03-13 5/250 2026-03-13 18:46 by 天空还下雨么
[考研] 材料301分求调剂 +5 Liyouyumairs 2026-03-12 5/250 2026-03-13 14:42 by JourneyLucky
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-12 4/200 2026-03-12 19:33 by 求调剂zz
[考研] 279求调剂 +3 莫xiao 2026-03-10 4/200 2026-03-11 08:06 by 斩魂滴兔子！
[考研] 收调剂 +7 调剂的考研学生 2026-03-10 7/350 2026-03-10 17:57 by 麦茶汤圆
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭