24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 5190  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

niuxiaoqi721

铜虫 (小有名气)

[求助] 过渡态消除虚频

过渡态收索出来以后,发现有两个虚频。一个一千多,一个一百多,怎样才能消除小的那个,看到有人用要消除的虚频*0.1-0.3加到原来的坐标上,可是不知道具体操作步骤,这里请高人指导,越详细越好。万分感谢,还有就是本人使用的是Dmol
回复此楼
加油
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yn1107

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by yadong80 at 2012-02-21 10:13:34
差别大并不能说明有问题,关键是看优化完了,是否满足唯一虚频,且其振动由反应物指向产物。我觉得你完全可以试试TS optimization,坦率地说,消虚频没有什么特别好的方法,都是按照其振动方式微调原子位置,TS opt ...

弱弱的问一句,TS optimization该怎么用?关键词是什么?  多谢了!
10楼2015-03-31 14:33:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

gongxd325

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
liliangfang(金币+1): 多谢指教 2012-02-20 15:04:11
论坛里有消虚频用的小软件,不过是针对Gaussian的结构,原理一样的,就是把结构稍作改动,把原来有虚频的结构对应的坐标增大或减小点(最好是观察虚频对应的振动模式后决定如何改变坐标)
一个人做点好事并不难难的是一辈子做好事!!!
2楼2012-02-20 13:50:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoboy185

金虫 (正式写手)

franch(金币+2): 谢谢回帖交流。。。。 2012-02-20 21:28:01
dmol这个找过渡态感觉不太靠谱啊
最好还是用vasp吧
3楼2012-02-20 19:13:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yadong80

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
WDD880227(金币+2): 感谢交流,有帮助 2012-02-21 08:37:09
你有用过TS optimization吗?这个功能就是解决你这个问题的,消除多余的虚频模,原理和二楼说的小工具差不多,只不过在MS里面自动完成了。DMol3默认情况下会自动选择频率最低的模作为由反应物指向产物的振动模,保留下来,而将其他的虚频模优化掉,当然,你也可以自己添加Key words:Opt_TS_Mode,选择需要保留的模,也就是你认为由反应物指向产物的振动模,这个模可以不是频率最低的模,譬如你提到的频率是负几十个波数的模。
4楼2012-02-20 22:47:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +6 争取九点睡 2026-03-28 6/300 2026-03-28 14:14 by Ainin_
[考研] 317求调剂 +6 十闲wx 2026-03-24 6/300 2026-03-28 13:27 by Iveryant
[考研] 调剂 +3 好好读书。 2026-03-28 3/150 2026-03-28 12:04 by 王保杰33
[考研] 数一英一271专硕(085401)求调剂,可跨 +4 前行必有光 2026-03-28 5/250 2026-03-28 11:27 by xuxiang
[考研] 085404求调剂,总分309,本科经历较为丰富 +4 来财aa 2026-03-25 4/200 2026-03-28 07:41 by 棒棒球手
[考研] 328求调剂 +7 嗯滴的基本都 2026-03-27 7/350 2026-03-28 04:19 by fmesaito
[考研] 295求调剂 +5 1428151015 2026-03-27 6/300 2026-03-28 04:04 by fmesaito
[考研] 275求调剂 +10 jjjjjjjjjjl 2026-03-27 10/500 2026-03-27 23:47 by barnett0632
[考研] 322求调剂 +4 我真的很想学习 2026-03-23 4/200 2026-03-27 13:51 by 杨杨杨紫
[考研] 一志愿北化求调剂 +3 Jsman 2026-03-22 3/150 2026-03-26 21:06 by ajpv风雷
[考研] 材料与化工304求B区调剂 +3 邱gl 2026-03-26 6/300 2026-03-26 18:03 by 邱gl
[考研] 085600 材料与化工 329分求调剂 +9 Mr. Z 2026-03-25 9/450 2026-03-26 10:36 by baoball
[考研] 打过很多竞赛,085406控制工程300分,求调剂 +3 askeladz 2026-03-26 3/150 2026-03-26 09:08 by 给你你注意休息
[考研] 302求调剂 +4 锦衣卫藤椒 2026-03-25 4/200 2026-03-25 16:29 by 功夫疯狂
[考研] 340求调剂 +5 话梅糖111 2026-03-24 5/250 2026-03-25 06:53 by ilovexiaobin
[考研] 上海电力大学材料防护与新材料重点实验室招收调剂研究生(材料、化学、电化学,环境) +4 我爱学电池 2026-03-23 4/200 2026-03-25 00:59 by 1027_324
[考研] 277分求调剂,跨调材料 +3 考研调剂lxh 2026-03-24 3/150 2026-03-24 13:52 by JourneyLucky
[考研] 344求调剂 +3 desto 2026-03-24 3/150 2026-03-24 10:09 by 搏击518
[考研] 求调剂一志愿海大,0703化学学硕304分,有大创项目,四级已过 +6 幸运哩哩 2026-03-22 10/500 2026-03-22 20:10 by edmund7
[考研] 求调剂院校信息 +6 CX 330 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:25 by 无懈可击111
信息提示
请填处理意见