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ycttfeng

木虫 (小有名气)

[求助] 很奇怪的连接产物

最近准备表达蛋白,首先扩增了目的片段,连到Blunt载体(3900多bp)上,测序正确。将目的片段(2200多bp)从Blunt上双酶切后回收,与pET16b(5700多bp)相连,挑了四个单克隆,提质粒双酶切后,总是出现这样的结果:目的片段大小是对的,但载体的大小不对。这到底是为什么为什么呢?已经出现了很多次这样的情况了,一直找不到原因。请各位高手指点

电泳图传不上来  郁闷啊。。。。。
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努力~
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yesucao

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
ycttfeng(金币+2): ★★★很有帮助 高人啊!切完后,载体的大小差不多就是3900这样子,接近4000,所以我严重怀疑是Blunt载体,但是想想,我切完Blunt-目的片段后,回收了目的片段那部分啊,所以怎么可能呢。。。。。。百思不得其解。。。。。 2011-12-21 20:25:01
西瓜(金币+3): Good! 2011-12-21 21:59:23
1、建议:单酶切和双酶切同时进行,切1-2h就足够了,不需要切4.5h,看看单酶切的时候总的大小是不是对的?
2、仔细检查pET16b载体上你选的那两个酶切位点是单一的
3、目前实验你发现酶切后载体变小了,那它现在是多少大小,和5700bp相差多少,和3900bp相差多少呢??这个仔细看一下
5楼2011-12-21 19:01:22
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rintor

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
ycttfeng(金币+1): 2011-12-24 09:17:47
酶切多长时间? 你确定载体上没有双酶切位点?
不要轻易言败
2楼2011-12-21 11:48:35
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ycttfeng

木虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by rintor at 2011-12-21 11:48:35:
酶切多长时间? 你确定载体上没有双酶切位点?

当初回收的时候是切过夜的 现在双酶切鉴定切了四个半小时 载体上有双酶切位点的啊
努力~
3楼2011-12-21 12:26:30
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yuxia82012

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
ycttfeng(金币+1): 谢谢!确定切开了,我加了没有经过酶切的做了对照 2011-12-21 20:26:48
你确定你是切开了?会不会是根本没切开,电泳出来的是线性质粒和超螺旋的,大的片段亮度要比小片段亮很多,仔细看看
在等待中涅槃重生
4楼2011-12-21 15:22:03
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