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gaofenglili银虫 (小有名气)
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新手请教用NEB方法计算energy barrier.
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想用NEB方法算体系的energy barrier, 请教各位大侠： 1. 我用nebmake.pl脚本产生中间状态的Image, 但是结构优化后都变成了几乎同一种最终结构，好像中间插入的各个结构之间没有相互作用和约束一样，得不知道是怎么回事，我的INCAR如下，请不吝指教： PREC = Mediate ENCUT = 500 EDIFF = 1E-5 EDIFFG = -0.05 ISMEAR = 0 SIGMA = 0.1 ISPIN = 2 LPLANE = .True. LWAVE = .False. LCHARG = .False. NPAR = 4 LSCALU = .False. ICHAIN = 0 IMAGES = 6 LCLIMB= .TRUE SPRING = -5.0 IBRION = 2 NSW = 500 POTIM = 0.1 NSIM = 4 ALGO = Fast LREAL = Auto 另外我的POSCAR1和POSCAR2中都写了selective dynamics, 然后让原子可移动，这样对吗？ 2. 对于初始结构应该单独进行计算吗？ 3. 我计算的体系是一个H原子从无限远接近吸附在表面的一个O，然后形成OH后又远离表面，这好像是两个过程啊，这种情况直接给出初态和末态位置用NEB方法计算好像不合理啊，是不是应该分两个过程算呢？ 谢谢了！  |
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贺仪(金币+1): 多谢你的热心帮助 2011-12-14 09:37:08
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不好意思，我可能理解错误了。我认为你的过程应该是两个，H吸附形成OH是一个，OH脱离又是一个，分开做就好了。如果你有催化剂的话必须考虑到H的物理吸附和O成键的过程，所以在催化剂下可能就是三个了，第一个是H吸附，之后H和O成键形成OH。最后OH脱离。 |
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gaofenglili5楼2011-12-10 09:16:19
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中间态自己估测一定要有依据不能乱选结构，中间态我个人认为一般都是一种稳态所以中间态你要拿出来自己去单独优化，vasp会找到其比较稳定的结构的。由于中间态的情况比较多，所以最后你也能给出很多路径，但是路径之间一定有一个最低的能垒的路径，那个基本可以认为就是反应的最佳路径了。 这样做应该可以的，一般你算出来的反应路径一定不只是一个，因为中间态存在一定排列组合的问题。对于所有的可能性进行分析才是最全面的。 |
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| 如果路径你知道的话，不需用分几步做，把中间的IMAGES多设几个，只要找到鞍点就可以了，但如果对称性不高，路径不清楚的话，建议使用CLNEB，你这个INCAR的参数也是写的CLNEB的，而你上面却写着NEB计算，都不知道你到底用的那个？而且我同意楼上的说法，你这个吸氧过程说不定是个稳态，NEB主要是研究非稳态的，你这个首先最好先验证下。 |
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8楼2011-12-12 10:49:17
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