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【求助】有人用dl_poly计算过solvation free energy吗？请教几个问题。。 已有5人参与
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我用的dl_poly2.20,在手册中提到计算溶剂化能需要进行下面的设定在CONTROL文件中 free start interval lambda mix system_a system_b endfre 我的问题是对于system_a 与system_b的设定，我的体系是一个溶质溶解在1000个溶剂中，如果我把system_a 这个设定设为0（就是空着这个），然后再system_b设定为溶质分子，我想问，这样设定，最后计算的自由能是什么自由能，就是有什么物理意义。手册中的例子35中它计算的是DMSO的激发态和基态之间的自由能的不同。所以他在体系中有 DMSO的激发态和基态..可是我计算溶剂化自由能应该怎么设定呢？？ |
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2楼2011-01-13 15:46:19
3楼2011-01-13 20:36:14
meixinqing
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LS参加的是以下这个workshop吗？ http://www.cse.scitech.ac.uk/ccg ... /DLP_Training.shtml 我对这个也比较感兴趣，不过没有机会去参加，不知道workshop上有没有什么lecture notes之类的pdf，若有的话LS能否共享下，万分感谢！ |
5楼2011-02-04 20:04:15
meixinqing
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DLPOLY TD integration的input block 大概是酱紫的 ××××××× ××××××× ××××××× ... ... ××××××× ××××××× AAAAAAAAA AAAAAAAAA AAAAAAAAA BBBBBBBBB BBBBBBBBB 其中××××××是溶剂 A 和B 是两个component 所计算的能量是 interaction between X and A interaction between X and B no interaction between A and B define on FIELD file 我大概理解成这样，基本上问到的东西写上来了，还有就是那个λ的公式，在manual的那一章有 |
8楼2011-02-15 06:27:51
9楼2011-02-15 16:53:15
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10楼2011-02-15 18:33:49
