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tianhuijuan金虫 (小有名气)
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nest-PCR引物设计的问题
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如题。nest-PCR,模板:猪肝中提取RNA,反转录成cDNA, DNA双链补平后与复性的marathon 16℃过夜连接。其中DNA双链经之前成功的引物验证过有条带。手动设计的引物如下: 外侧引物: thjAP1(f) 5′-CCATCCTAATACGACTCAC-3′ primer A (r) 5′-CAC CAT TgT CAA Tgg TgA gA-3′ 内侧引物: thjAP2(f) 5′-GGCCGGATCCTATAGGGCTCGAGCGGC-3′ primer B(r) 5′-CCg CCg CTC gAg Tgg TAC AgT AAC AAC TgC AT-3′ 循环条件: Stage 1 Step 1 95℃ 5 min ×1 cycle Stage 2 Step 1 93℃ 40 sec Step 2 56℃ 60 sec × 29 cycles Step 3 72℃ 60 sec Stage 3 Step 1 93℃ 40 sec Step 2 56℃ 60 sec ×1 cycle Step 3 72℃ 20 min Hold at 12℃ 其中,退火温度和延伸时间都做过调整,均没有改善,都是只有引物间的二聚体。 请教高手虫友们,引物是否存在问题,亦或是其它的问题呢? |
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