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tianhuijuan

金虫 (小有名气)

[求助] nest-PCR引物设计的问题

如题。nest-PCR,模板:猪肝中提取RNA,反转录成cDNA, DNA双链补平后与复性的marathon 16℃过夜连接。其中DNA双链经之前成功的引物验证过有条带。手动设计的引物如下:
外侧引物:
thjAP1(f) 5′-CCATCCTAATACGACTCAC-3′
primer A (r)  5′-CAC CAT TgT CAA Tgg TgA gA-3′
内侧引物:
thjAP2(f)  5′-GGCCGGATCCTATAGGGCTCGAGCGGC-3′
primer B(r)  5′-CCg CCg CTC gAg Tgg TAC AgT AAC AAC TgC AT-3′
循环条件:
Stage 1        Step 1        95℃        5 min       ×1 cycle
Stage 2        Step 1        93℃        40 sec
        Step 2        56℃        60 sec     ×  29 cycles
        Step 3        72℃        60 sec
Stage 3        Step 1        93℃        40 sec
        Step 2        56℃        60 sec     ×1 cycle
        Step 3        72℃        20 min
Hold at 12℃
其中,退火温度和延伸时间都做过调整,均没有改善,都是只有引物间的二聚体。
请教高手虫友们,引物是否存在问题,亦或是其它的问题呢?
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