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xiaoyang123

金虫 (小有名气)

[求助] PCR产物用CyberGreen染色时遇到的问题

今天第一次用SYBR Green代替EB进行染色,照胶后显示的结果有点诡异:marker和引物二聚体异常明显,和marker一样亮,其它的条带什么都没有,干干净净的。并且1000bp的引物没有跑开,全都聚集在底部,且拖带严重。重复了两次实验均是以上结果。

我的目标片段在1100bp左右,会不会是跑出来了但是没染上,看marker的样子,貌似越接近底部(即分子量越低),条带越亮,而胶的中上部分几乎没有任何条带了。

不知是否是我的使用方法出现了问题——我配了40mL的胶(1%琼脂糖),在倒胶前,几乎不烫手的时候,加入4μL的SYBR Green(如说明书所示1/10000),混匀后倒胶。
跑完电泳立刻照胶。

会不会是因为没有静止足够的时间呢,或者SYBR Green比较不容易和长片段结合?

之前用EB泡胶的时候引物二聚体并没有这么严重,而且有许多条带(包括许多非特异性扩增),可是用SYBR Green却是以上结果。感觉有点诡异,不知何解,还望各位多多指教~~~
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沾欢欢

金虫 (正式写手)

啦啦啦


【答案】应助回帖

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xiaoyang123: 金币+3, 有帮助 2012-04-19 18:52:47
不要把sybr 加到胶里面,这样跑出来的照片背景很亮
你把它和loading buffer 以及样品混合,混匀大约五分钟以后点样就可以了~试试看吧
2楼2011-12-19 12:41:15
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