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xiaoyang123金虫 (小有名气)
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PCR产物用CyberGreen染色时遇到的问题
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今天第一次用SYBR Green代替EB进行染色,照胶后显示的结果有点诡异:marker和引物二聚体异常明显,和marker一样亮,其它的条带什么都没有,干干净净的。并且1000bp的引物没有跑开,全都聚集在底部,且拖带严重。重复了两次实验均是以上结果。 我的目标片段在1100bp左右,会不会是跑出来了但是没染上,看marker的样子,貌似越接近底部(即分子量越低),条带越亮,而胶的中上部分几乎没有任何条带了。 不知是否是我的使用方法出现了问题——我配了40mL的胶(1%琼脂糖),在倒胶前,几乎不烫手的时候,加入4μL的SYBR Green(如说明书所示1/10000),混匀后倒胶。 跑完电泳立刻照胶。 会不会是因为没有静止足够的时间呢,或者SYBR Green比较不容易和长片段结合? 之前用EB泡胶的时候引物二聚体并没有这么严重,而且有许多条带(包括许多非特异性扩增),可是用SYBR Green却是以上结果。感觉有点诡异,不知何解,还望各位多多指教~~~ |
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