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doudouxiong

铜虫 (小有名气)

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[求助] 真菌基因组DAN提取图片，求高人指点

这是我提取的真菌基因组的DNA，因为材料量比较少的问题，因此采用液氮研磨，然后再用CTAB研磨，后用氯仿异戊醇抽提两次，然后用酒精洗，结果每次检测的图片都是这样，请问这是DNA降解还是蛋白质污染，如果是DNA降解，那么是我研磨的时候降解的吗？可能有那种情况就是研磨的时候把DNA研磨断了或者是破了导致的降解这一说法吗？

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1楼2011-10-16 15:53:52

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Petter_JDW

木虫 (小有名气)

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1.液氮研磨时候可以加一些石英砂，增加摩擦效果，就可以适当减少研磨时间；
2.尽量在冰上操作，研钵也要事先在-20度或-80度冰箱预冷；
3.可以加一些RNAase，提取过程尽量动作快准轻！
4.你用的染料是EB的话，RNA也会看得很清楚；如果要图好看可以试试Golden View，这个可能对RNA显色不太好；
5.其实，如果提基因组的重点一般是为了下游工作，你可以先做做看；只要可以继续下去没必要纠结于这个，对有的步骤追求完美是没意义的，也是费时耗力的；
祝顺利！！！！！

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17楼2011-10-21 22:06:19

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