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zaasyangyong

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[交流] 一个关于水稻基因图位克隆的问题诚挚恳求大牛解答

一个关于水稻基因图位克隆的问题诚挚恳求大牛解答

我在做一个类病变突变体的基因图位克隆。

首先，突变体和它的野生型杂交确定显隐性，F2分离群体内突变型：野生型=1：3，卡方检测差异不显著，说明单基因隐性；

接着，用突变体和籼稻9311杂交，选F2有限群体进行粗定位，结果问题来了。选了突变型50个单株，无突变表型28个单株。全基因组筛到一个标记，在50个突变群体内，突变体的带型：9311的带型：杂合带型=40：1：9。感觉应该和这个标记有连锁。然而，在28个无突变表型群体内，突变体的带型：9311的带型：杂合带型=11：6：11。开始怀疑是不是单株取错了，又取了一批叶片，结果还是突变体的带型很多，和突变群体内的比例完全不是一个类型的趋势。

真是百思不得其解，恳求大牛解答，到底是肿么回事啊？

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1楼 2011-10-04 21:16:19

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zaasyangyong

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★ ★ ★
wanhscn(金币+3): 鼓励交流！ 2011-10-10 09:57:37

引用回帖:

5楼: Originally posted by wanhscn at 2011-10-05 22:19:07:
40+11=51个突变带型, 其中没有突变表性的11铢,交换11/51=20%, 遗传距离20CM,没有连锁!

但是如果只看突变表型的群体，50个有40个是突变体的带型，应该有连锁啊，只是可能标记与目的基因远些，有些交换株；纳闷的就是野生型表型的群体，开始怀疑是取错了叶片了，比如说有些类病变幼苗时期没表型，成株期才有；但是又取了一批，还是如此，就是说两个池遗传动向不一样，但是突变体和它的野生型杂交就很好的1：3分离，而籼粳杂交就不对了。