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zaasyangyong

金虫 (正式写手)

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[交流] 一个关于水稻基因图位克隆的问题诚挚恳求大牛解答

一个关于水稻基因图位克隆的问题诚挚恳求大牛解答

我在做一个类病变突变体的基因图位克隆。

首先，突变体和它的野生型杂交确定显隐性，F2分离群体内突变型：野生型=1：3，卡方检测差异不显著，说明单基因隐性；

接着，用突变体和籼稻9311杂交，选F2有限群体进行粗定位，结果问题来了。选了突变型50个单株，无突变表型28个单株。全基因组筛到一个标记，在50个突变群体内，突变体的带型：9311的带型：杂合带型=40：1：9。感觉应该和这个标记有连锁。然而，在28个无突变表型群体内，突变体的带型：9311的带型：杂合带型=11：6：11。开始怀疑是不是单株取错了，又取了一批叶片，结果还是突变体的带型很多，和突变群体内的比例完全不是一个类型的趋势。

真是百思不得其解，恳求大牛解答，到底是肿么回事啊？

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1楼 2011-10-04 21:16:19

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wanhscn

木虫 (职业作家)

★
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引用回帖:

11楼: Originally posted by zaasyangyong at 2011-10-06 16:05:28:
大家多多说说肿么回事啊？这么看来，如果筛选的点是对的，在F2群体里有些携带突变基因的单株不表现表型，还是其它怎么地？还是这个点就是错的？到底要继续这个点精细，还是要再重新粗筛？

可是已经全基因组筛选 ...

你筛的这个标记（认为与基因有连锁的）与你晒过的与它最近的标记能连在同一连锁群吗？两个亲本的不同带型在同一遗传位置吗？PAGE图上来看看！