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ybs007

金虫 (小有名气)

[求助] 双酶切的片段不见了?

向大家请教一个问题,我最近在做转化,用的是pET-30a,连的片段为400bp,酶切位点为kpnI和HindIII,但是双酶切后,却没找到400的片段。之后我又分别做了单酶切,对照验证两个酶都有效的切开了质粒,但是就是没有400bp的目的片段,很纠结,很纠结,望各位虫友搭救!!!(PS:我用载体通用引物扩增的时候能扩出来720的片段,说明目的片段应该连上了)
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平生我自知
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+5, MolEPI+1): 2011-08-30 17:12:00
ybs007(金币+5): 感激不尽 2011-08-31 10:18:26
其实照楼主所说已经得到了重组载体,而且你基本已经确定正确了,就是需要一张perfect的酶切图把?
其实照你所说的,因为你的载体上连接的片段是400bp,相对较小一些,你的载体大小5.4kb,是基因的将近14倍,酶切的话应该选择一个稍微大一点的体系,至少得20ul以上,而且你要确保你的重组载体量足够大,就是电泳显示比较亮,这样你酶切之后才会看到那条400bp比较小的条带。。。如果重组载体量很少,那么直接over,不用酶切了,肯定看不到的。。。
我原来也遇到过类似的问题,你可以参看我这篇帖子,相信你一看就知道该如何去做了!
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3357650

祝好运!
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
7楼2011-08-30 15:35:10
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
amisking(金币+1): 鼓励应助 2011-08-26 20:02:29
ybs007(金币+2): 嗯 我的师哥建议我用中提试试 2011-08-27 09:38:09
量少的话确实看不到小片段的,毕竟400片段只有大片段(5K)的十几分之一呀。
2楼2011-08-26 19:47:53
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和一

银虫 (著名写手)

★ ★ ★
dhd997(金币+3): 3Q 2011-08-30 08:03:54
我曾经也出现过这个问题,用的是PET28A,连接的片段是402bp,双酶切后402bp的片段看不见,后来用碱裂解法重提质粒,结果切出来了。分析原因,可能是用小提试剂盒提出的质粒量比较少,连接的片段又小,电泳上显示不出来。碱裂解法提出的质粒量比较大,楼主不妨试试。
3楼2011-08-27 11:25:37
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lingbi

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
dhd997(金币+2): good 2011-08-30 08:04:02
ybs007(金币+1): 2011-09-03 11:33:34
也许这两个酶不太好切,或者其中一管污染。先用第一个酶单切5小时,直接回收后再用第二个酶及其高效buffer 温度切2小时,电泳再看
4楼2011-08-29 21:18:16
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