| 查看: 4877 | 回复: 9 | ||||||
| 本帖产生 1 个 MolEPI ，点击这里进行查看 | ||||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||||
jacber木虫 (正式写手)
|
[求助]
关于生物进化发育树之类的分析
|
|||||
| 我最近才接触这方面的内容，很多原理性的东西都不是很了解，特别是在微生物鉴定后怎么分析其同源性，生物进化发育树等，有没有人提供下相关的统计分析之类的资料啊 ，万分感激，有合适提供者再追加大奖 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 【分子生物】EPI帖 | 土壤真菌 | 土壤真菌 | 写论文用 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
zhengyaoyao» 猜你喜欢
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有248人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
-
氢氧化钾活化操作
已经有18人回复
-
散金
已经有68人回复
-
生物质超级电容器
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 谁能帮我分析一下系统进化树？
已经有7人回复
- 系统发育树如何分析，得出结论？
已经有13人回复
- 基于氨基酸的系统发育树的构建
已经有6人回复
- 建系统发育树时怎么样才能调高bootstrap值啊？送金币
已经有34人回复
- MEGA 5.0构建系统发育树的问题
已经有10人回复
- 怎样建立基因文库，以及用它建立生物发育树
已经有9人回复
- 关于怎样建立基因文库，并通过文库建系统发育树
已经有9人回复
- 系统发育树的节点与亲缘关系问题求助
已经有7人回复
- 真菌种属鉴定 系统发育树构建
已经有5人回复
- 【求助/交流】系统进化树的分析问题
已经有4人回复
- 【求助/交流】（求助）急 回答就送金币啊关于mega 和phylip 画出来的系统发育树
已经有5人回复
- 【求助/交流】序列人工校正与构建系统发育树
已经有8人回复
- 【求助/交流】关于系统发育树，如何鉴定菌种
已经有12人回复
- 【分享】《分子进化与系统发育》【已搜索无重复】
已经有9人回复
JessieDai
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 144.3
- 散金: 270
- 帖子: 115
- 在线: 76.7小时
- 虫号: 1029992
- 注册: 2010-05-27
- 性别: MM
- 专业: 环境工程
4楼2011-08-25 14:57:32
jinkui960
至尊木虫 (知名作家)
- MolEPI: 22
- 应助: 1220 (讲师)
- 金币: 10246.5
- 散金: 1000
- 红花: 42
- 沙发: 1
- 帖子: 5797
- 在线: 517.3小时
- 虫号: 1327313
- 注册: 2011-06-20
- 性别: GG
- 专业: 生物防治
【答案】应助回帖
1949stone(MolEPI+1): 果然很辛苦啊 2011-08-03 17:42:28
jacber(金币+5): 谢谢 2011-08-03 18:31:34
jacber(金币+5): 1 2011-08-06 02:17:02
jacber(金币+5): 谢谢 2011-08-03 18:31:34
jacber(金币+5): 1 2011-08-06 02:17:02
|
一般来说，在克隆得到微生物的保守序列，真菌如ITS序列，细菌如16S rRNA序列以后，先在NCBI上进行Blast检索，确定哪些序列和哪些微生物的相似性比较高，然后下载相似性比较高的序列，最好是下载标准菌株的序列，这样结果更可信。 序列下载了以后，就可以用Clustal软件进行序列比对，并根据自己的目的利用不同的软件构件系统发育树，一般新手常用的构树软件是Mega（4.0）。由于一种软件或者方法构出来的树可能存在一些偏差（Bias）,所以一般采用不同的软件和不同的方法构树，如果不同软件、不同方法构出的树的拓扑结构一致的话，结果会更可信。 不同的进化发育树选择不同的方法，构建NJ树，可以用PHYLIP或MEGA；构建MP树，最好的工具是PAUP；构建ML树可以使用PHYML；贝叶斯树用MrBayes软件。ML树和贝叶斯树要花很长的时间，尤其是贝叶斯树还需要专用电脑。一般的杂志用MEGA也被认可！ 网上有很多这方面的文献，可以参考： 1）进化树构建需要哪些工具 http://zhidao.baidu.com/question/145295640 2）分子进化树构建及数据分析的简介 http://wenku.baidu.com/view/0f4c852c2af90242a895e541.html 希望对你有帮助！ |
2楼2011-08-03 16:56:04
jinkui960
至尊木虫 (知名作家)
- MolEPI: 22
- 应助: 1220 (讲师)
- 金币: 10246.5
- 散金: 1000
- 红花: 42
- 沙发: 1
- 帖子: 5797
- 在线: 517.3小时
- 虫号: 1327313
- 注册: 2011-06-20
- 性别: GG
- 专业: 生物防治
5楼2011-08-25 17:44:51
寻找丢失的ID
木虫 (正式写手)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 3458.5
- 散金: 48
- 帖子: 348
- 在线: 200.8小时
- 虫号: 1753040
- 注册: 2012-04-13
- 性别: GG
- 专业: 食品科学基础
6楼2012-04-26 21:39:39
20