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happywoheni

铁虫 (小有名气)

[求助] 【求助】基因克隆T载体酶切问题等

求助啊,本人纯属菜鸟,问题较多,请大家帮帮忙!
1:引物中添加的限制性酶切位点是选择T载体上有的还是没有的?完全不懂!
2:我做基因克隆,用的上游引物5‘加了BamH1酶切位点,下游引物5’加了EcoR1酶切位点,可以用宝生物的pmD-19 T载体吗?
3:我现在做pcr产物的纯化,想问一下,下一步T载体和pcr产物都要经过双酶切之后,再连接吗?还是T载体可以不用双酶切,只是pcr产物双酶切?还是其他?
4:pcr产物可以直接双酶切吗,酶切缓冲液用哪一种,温度一个是30度一个是37度。
5:如果T载体不用酶切,直接连,酶切鉴定作用是什么?怎么做?用这两种限制性内切酶切吗?切完之后是不是有很多段?
5:蓝白斑筛选操作步骤

在线等,急……
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tupac225

金虫 (正式写手)

T 载体设计出来的目的就是不用双酶切pcr产物,pcr产物可以和载体直接连接,然后再酶切回收目的pcr产物,连接,构建从组载体。
coasttocoast。
9楼2012-07-06 16:09:42
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friya0910

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


西瓜(金币+1): 鼓励应助 2011-07-06 21:06:34
happywoheni(金币+1): 2011-07-07 07:17:02
引用回帖:
Originally posted by happywoheni at 2011-07-06 20:12:08:
求助啊,本人纯属菜鸟,问题较多,请大家帮帮忙!
1:引物中添加的限制性酶切位点是选择T载体上有的还是没有的?完全不懂!
2:我做基因克隆,用的上游引物5‘加了BamH1酶切位点,下游引物5’加了EcoR1酶切位点 ...

你用的载体是宝生物的pMD19-T载体吗?如果是的话,载体本身也带有BamHI的酶切位点的,还有你把目的基因连到T载体以后是要测序吗?还是要做什么后续实验啊?反正我之前用这个载体都是直接把目的片段和载体连接的,不用酶切,你可以看看宝生物的说明书的。
2楼2011-07-06 20:32:25
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happywoheni

铁虫 (小有名气)

是用的宝生物的pMD19-T载体,连接完了要导入到大肠DH5a中。我的意思是我的引物和T载体有相同的两个限制性内切酶,会不会有影响?
3楼2011-07-06 22:42:45
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
西瓜(金币+5, EPI+1): 果断EPI 2011-07-06 23:20:43
引物中选择的酶切位点最好是在T载体上没有的,因为T载体连接上外源片段,验证正确之后,要双酶切质粒后跑电泳来回收外源片段。如果载体上有你设定的酶切位点,那么双酶切之后就不是只有载体和外源片段两条带了,但是如果你能保证不干扰你要回收的外源片段,双酶切之后你的外源片段还是能与其它条带分开,那么就没关系。
BamH1和EcoR1都是很常用的酶,一般载体上都有的,依照我上面说过的,只要能保证效果就可以。但是如果两个酶切位点相距太近,第一个酶切了之后第二个酶会结合不上去的。
T载体和PCR产物的连接不用双酶切,因为T-A连接是利用Taq酶在PCR产物3'末端有加上一个A的特性,使得Taq酶的PCR产物或经过Taq酶加A的PCR产物,和一个人工加上一个3'末端具有1个T的载体进行连接,由于突出末端可以互补,所以不用再进行其它酶切就能连接。
pcr产物最好别直接双酶切吗,经过回收之后再双酶切,体系里的其它物质会少一些,但是你的第三个问题解决了,这第四个问题就没有必要回答了。
双酶切验证是不保险的,最好是送测序,因为双酶切只能说明片段大小,不能知道是否有点突变。
蓝白斑筛选的原理见
http://baike.baidu.com/view/961540.htm
http://wenku.baidu.com/view/acb85ffbaef8941ea76e05c5.html
看完了就知道怎么做了。
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
4楼2011-07-06 23:09:00
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