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biofeixue

木虫 (著名写手)

[求助] 没有polyA怎么逆转录?

我最近查了一些基因,想看看他们受环境的影响是表达多了还是少了?
结果发现这些基因的3端都没有polyA尾巴,为什么?另外如果没有polyA尾巴,我怎么逆转录?
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yj507

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

biofeixue(金币+5): 2011-05-28 15:04:50
biofeixue(金币+1): 2011-06-07 08:18:06
引用回帖:
Originally posted by yujiaping1 at 2011-05-27 13:58:39:
没有polyA就不用oligo dT,这个实验他的目的就是想看该基因的表达,那么不用oligo dT最好,因为oligo dT是非特异性的,用来做所有mRNA的反转录有用,用来做特异基因的哪有什么意义

顶起~
提取RNA后,直接设计该基因的特异引物和看家基因引物做RT,然后QPCR定量就可以比较表达量的差异了。oligodT或N6是对所有polyA或转录本逆转,对于这个实验更麻烦。
7楼2011-05-27 17:12:45
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yabxxh

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
biofeixue(金币+5): 2011-05-27 09:30:18
西瓜(金币+5, EPI+1): 一般试剂盒都配有随机引物(一般是random 6 mers)和Oligo dT,楼主用随机引物做反转录就可以了。也可以自己设计基因特异的引物来反转录,跟PCR引物差不多。推荐前者。 2011-05-27 12:56:37
...,基因的话,按照其结构应该是有polyA的,可能你找的是编码区吧。
没有polya的话你可以用随机引物,或者你自己的特定引物来反转录啊
好运
2楼2011-05-27 09:29:18
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yujiaping1

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

西瓜: 有poly A可以用Oligo dT作为反转录的引物啦。 2011-05-27 12:58:14
biofeixue(金币+2): 2011-05-28 15:03:38
你的实验目的,依我看polyA根本没意义,你就做反转录就是了,需要定量就用RT-realtime PCR
3楼2011-05-27 12:30:56
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yujiaping1

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
dhd997(金币+3): 鼓励交流 2011-05-27 19:27:06
biofeixue(金币+3): 2011-05-28 15:03:56
biofeixue(金币+1): 2011-06-07 08:17:55
引用回帖:
Originally posted by yujiaping1 at 2011-05-27 12:30:56:
你的实验目的,依我看polyA根本没意义,你就做反转录就是了,需要定量就用RT-realtime PCR

没有polyA就不用oligo dT,这个实验他的目的就是想看该基因的表达,那么不用oligo dT最好,因为oligo dT是非特异性的,用来做所有mRNA的反转录有用,用来做特异基因的哪有什么意义
4楼2011-05-27 13:58:39
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