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fengzheng770铜虫 (初入文坛)
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[交流]
为什么查到的cDNA序列PolyA后面还会有序列？ 已有5人参与
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| 为什么在genbank数据库查到的cDNA序列有些在polyA后面还有序列，不是本身mRNA就是以polyA结束的吗?反转录时引物是oligo（dt）？怎么会出现序列？ |
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2楼2009-08-02 23:24:07
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大概长50多，查到的mRNA序列也不太一致，polyA后面的序列有长有短。 如AF141379 ，在AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA后面有一段序列，然后又是AAAAAAAAAAAAAAAA，经和同源序列比较，第一个AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA后面就应该结束了，而后面的序列和AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA是什么？ ATCCAGCCTCCAAAATGATCCAAGTTCTCTTGGTAACCATATGCTTAGCAGCTTTTCCTTATCAAGGGAG CTCTATAATCCTGGAATCTGGGGACGTGAATGATTATGAAGTAGTCTATCCACGAAAAGTCACTGCATTG CCCAAAGGAGCAGTTCAGCAAAAGTATGAAGACGCCATGCAATATGAATTTAAAGTGAATGGAGAGCCAG TGGTCCTTCACCTGGAAAAAAATAAACATCTTTTTTCAAAAGATTACAGCGAGACTCATTATTCCCCTGA TGGCAGAGAAATTACAATAAACCCTCCGGTTGAGGATCACTGCTATTATCATGGACGCATCGAGAATGAT GGTGACTCAACTGCAAGCATCAGTGCATGCAATGGTTTGAAAGGAAATTTCAAGCTTCAAGGGGAGACGT ACCTTATTGAACCCATGAAGCTTTCTGACAGTGAAGCCCATGCAGTCTTCAAATATGAAAATGTAGAAAA AGATGAGGCCCCCAAAATGTGTGGGGTAACCCAGAAGTGGAAATCATATGAGCCCATCAAAAAGATCTCT CAGTTAAATCTTATTCCTGAACAACAAATCTATGACCCCTTCAAATACGTTGAGACTGTCGTTGTTGTGG ACAAAGCAATGGTCACAAAATACAATGGCGATTTAGATAAGATAATAACAAAAATGTACGAAGCTGCCAA CAATATGAATGAGATGTACAGATATATGTTTTTTCGTGTAGTAATGGTTGGCCTAATAATTTGGACCGAA GAAGATAAGATTACCGTGAAGCCAGATGTGGATTATACTTTGAACGCATTTGCAGAATGGAGAAAAACAT ATTTGCTGGCTGAGAAAAAACATGATAATGCTCAGTTAATCACGGGCATTGACTTCCGAGGAAGCATTAT AGGATACGCTTACATTGGCAGCATGTGCCACCCGAAGCGTTCTGTAGGAATTATTCAGGATTATAGCCCA ATAAATCTTGTGCTTGCCGTTATAATGGCCCATGAGATGGGTCATAATCTGGGCATACATCATGACGACG GTTACTGTTATTGCGGTGGTTACCCATGCATTATGGGTCCCTCGATAAGCCCTGAACCTTCCAAATTTTT CAGCAATTGTAGTTATATCCAATGTTGGGACTTTATTATGAATCACAACCCAGAATGCATTGACAATGAA CCCTTGGGAACAGATATTATTTCACCTCCACTTTGTGGAAATGAACTTTTGGAGGTGGGAGAAGAATGTG ACTGTGGCACTCCTGAAAATTGTCAAAATGAGTGCTGCGATGCTGCAACGTGTAAACTGAAGTCAGGGTC ACAGTGTGGACATGGAAAATGTTGTGAGCAATGCAAATTTAGGACATCAGGAACAGAATGCCGGGCATCA ATGAGTGAATGTGACCCAGCTGAACACTGCACTGGCCAATCTTCTGAGTGTCCTGCAGACGTCTTCCATA AGAATGGGGAACCATGCCTAGATAACTACGGTTACTGCTACAATGGGAATTGCCCCATCATGTATCACCA ATGTTATGCTCTCTTTGGTGCAGAAGTTTATGAGGCTGAAGATTCATGTTTTGAGAGTAACAAGAAAGGC AATTATTATGGCTACTGCAGAAAGGAAAATGGTAAAAAGATTCCATGTGCATCAGAAGATGTAAAATGTG GCAGGTTATACTGCAAAGATGATTCACCTGGACAAAATAATCCTTGCAAGATGTTCTATTCCAATGACGA TGAACATAAGGGAATGGTTCTTCCTGGAACAAAATGTGCAGATGGAAAGGTCTGCAGCAACGGGCATTGT GTTGATGTGACTACAGCCTACTAGTCAACCTCTGGCTTTGATTTTGGAGATCCTCCTTCCAGAAGGTTTG GCTTCTCTCAAGTCCAAAGAGATCCATCTGCCTGTATCTTACTAGTAAATCACCCTTAGCTTCCAGATGG CATCCAAATTCAGCAATATTTCTTCACCATATTTAATCTGTTTACCTTTTGCTGTAATCAAACCTTTTCC CCACCACAAAGCTCCATGGGCATGTACAACACACCAAGGGCTTATTTGCTGTCAAGAAAAAAATGGCCAT TTTACCATTTGCCAATTGCAGAGCACATTTAATACAACAAGTTCTGCCTTTTGAGCTGGTGTATTCGAAG TCAATGCTTCCTCTTCCAAACTTTTGTGCTGGCTTTCCAAGATGTAGCTGCTTCCATCAATAAACTATTT TCATTCTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTTTACTTTGATGTGATGCTGTG CAAGCAAGGTATCACAGATGTAAAAGCAGCTTTGGTGGTCGAAATATCTGTCTGCAGGGGAAACACGAAA CATTCCTTGTTTACTGAACCAGATTTGCAGCCTTCCGGATACTAACAGTCTCTTATGTCTCTGATTGTTT CAGTTTGTAAAGAGAAGCTTTTAAAAGAAATCCTTAAAATCAAAAAAAAAAAAAAAAA |
4楼2009-08-04 18:07:26
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