请教高手电泳为什么是蛋白质小分子跑在最下面 - 分子生物 - 综合其他

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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
西瓜(金币+5, EPI+1): 学习了！ 2011-05-12 19:17:47

SDS可以与蛋白质结合，使得蛋白质带上比自己氨基酸残基侧链多得多的电荷，使得每个蛋白质的电荷密度与原本等电点和分子量无关。而且SDS与蛋白质的结合物构型都是短棒型，只是随分子量大小而变长。聚丙烯酰胺凝胶内部有很多大小不一的孔径，小分子的短棒容易通过，大分子的棒受到小孔径的阻挡，只能通过大孔径才能顺利通过，所以最终小分子短棒速度快，大分子长棒速度慢。

需要注意的是，这确实是分子筛效应，但是这个的所有孔径都在凝胶上，凝胶处于夹板之间没有空隙，不存在没有凝胶的空间，长棒不能通过没有孔径的空隙穿过。这和Sephadex凝胶过滤分离蛋白质不一样，Sephadex凝胶是球状，存在外水体积，洗脱液不带电，蛋白质依靠分子量来分离，小分子蛋白质能穿过众多小孔径和大孔径所以速度最慢，大分子蛋白质不能穿过小孔径只能穿过大孔径和无孔径的外水体积所以出来最快。