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a83875785

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】WB中,核蛋白内参和总蛋白内参的问题 已有11人参与

被告知核蛋白内参Histone和总蛋白内参贝塔-actin分别是用于核蛋白的蛋白衡量和总蛋白的蛋白衡量,但是我不知道为什么要这样,那么如果用Histone用于总蛋白的蛋白定量会怎么样?或者actin用于核蛋白的衡量会怎么样?谢谢了
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mkcc

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
b-actin是胞浆表达,Histone是胞核表达。细胞蛋白主要是在胞浆,所以b-actin的量要比Histone大的多。

用b-actin还是Histone做内参,主要看你提取的是总蛋白还是核蛋白。如果提的是总蛋白,必须用b-actin,提的是胞核蛋白,必须用Histone,如果你提取的是总蛋白,但用了Histone,结果可能是做不出来或者条带很弱(Histone相对于总蛋白来说太少)。而如果提取的是核蛋白,用b-actin做内参,结果则可能是做不出来(核内没有表达),或者内参条带不均匀(混入少量胞浆蛋白)

一般来说,如果你的目的蛋白在胞浆表达,那当然毋庸置疑,提取总蛋白,用b-actin,但如果在核表达,可以提总蛋白,也可以提核蛋白。但有些核蛋白的表达量比较低,提总蛋白可能就太稀了,所以要专门提取核蛋白。
9楼2013-01-16 13:30:15
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
用胞浆蛋白来估算核蛋白就跟薛定谔的猫一样微妙~~
2楼2011-04-13 21:46:47
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reasonspare

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
lstt09nk(金币+5): 欢迎回归^_^ 2011-04-16 19:15:39
silicare(EPI+1): 2011-04-18 18:56:22
引用回帖:
Originally posted by a83875785 at 2011-04-13 21:37:06:
被告知核蛋白内参Histone和总蛋白内参贝塔-actin分别是用于核蛋白的蛋白衡量和总蛋白的蛋白衡量,但是我不知道为什么要这样,那么如果用Histone用于总蛋白的蛋白定量会怎么样?或者actin用于核蛋白的衡量会怎么样 ...

Histone用于总蛋白的蛋白定量会怎么样?
或者actin用于核蛋白的衡量会怎么样?

我不知道你为什么这么想问题。也不知道你为什么有这种疑问?

组蛋白是和DNA等核酸组合在一起形成核蛋白,换句话,核蛋白组成成分是组蛋白,也非常保守,不会因为受到处理而减少。所以用于作为内参。

B-actin,至于为什么作为总蛋白的内参,我不想过多解释。


但是如你所说,如果反过来,肯定不行。
大慈大悲观世音救苦救难观世音有求必应观世音普渡众生观世音千手千眼观世音官大敢管观世音无处不在观世音普观普长观世音南无观世音菩萨
3楼2011-04-14 11:50:19
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314300420

捐助贵宾 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
reasonspare(金币+3): 谢谢分享 2011-04-16 11:06:28
silicare(EPI+1): 2011-04-18 18:57:07
引用回帖:
Originally posted by a83875785 at 2011-04-13 21:37:06:
被告知核蛋白内参Histone和总蛋白内参贝塔-actin分别是用于核蛋白的蛋白衡量和总蛋白的蛋白衡量,但是我不知道为什么要这样,那么如果用Histone用于总蛋白的蛋白定量会怎么样?或者actin用于核蛋白的衡量会怎么样 ...

有些人提取蛋白会选择胞浆、胞核分开提取,不提取总蛋白,所以做内参要选择相应部位表达稳定的蛋白。beta-actin在胞浆中表达高效稳定,而总蛋白主要成分就是胞浆蛋白,所以beta-actin可以作为总蛋白的内参。理论上细胞核内不表达beta-actin,所以不能用于核蛋白内参。同理,细胞核内的蛋白用于做总蛋白的内参,自然也不合理,内参自当选择与目的蛋白表达部位相同的蛋白才有说服力。
实际情况中,无论什么试剂盒,都不可能完全将胞浆、胞核蛋白完全分离开,提取时总会有交叉污染。就是提取的核蛋白肯定会有beta-actin,而胞浆蛋白也会有核蛋白的存在,所以你用两种蛋白做内参都能有结果,只是有的科学合理,有的不科学,没有说服力。
4楼2011-04-14 16:30:01
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