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【求助/交流】土壤总DNA的离心柱纯化问题
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camel315
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[交流]
【求助/交流】土壤总DNA的离心柱纯化问题
目前我在手工提取土壤总DNA的时候,需要用离心柱纯化DNA。DNA粗提液的OD260含量比较低,但230nm的杂质较多。我用Mobio公司的试剂盒就不存在这个问题,他们的离心柱的材质可能比较好,可以有效除去粗提液中的各种杂质。国内商用的纯化试剂盒一般只对PCR产物(或者说片段<10kb)的核酸比较有效,而对基因组DNA的纯化效率比较低(<50%,甚至<30%).各位虫友,有谁用过成熟的(硅胶或者树脂)离心柱,可以有效除杂(主要是腐殖酸和盐类)?不妨给点建议。
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2011-04-11 11:13:23
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bioteke的试剂盒我问了,50次的1500元,价格还是非常高的,而且不提供试用装。跟mobio的power soil DNA isolation kit差不多了。其实是基于zhou(1996)方法,加入了离心柱除杂步骤。但是他的离心柱不单卖。
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4楼
2011-04-11 16:23:50
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其实这个东西对有机分析的人员来说,应该不是什么太难的问题。只是没人或者没有动力去弄这个。
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2011-04-11 16:24:57
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不知哪位虫友知道,现在试剂盒中用到的硅胶膜的孔径或者颗粒是多大的?
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7楼
2011-04-19 10:24:12
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谢谢热心人提供的信息
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2011-04-26 10:15:50
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Mobio对腐殖土还是很对症的。也许你的样品中的微生物数量本来就少。如果是这样,可以考虑富集。同时考虑在提取前,60~65℃水域处理10分钟,提高裂解效率。
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11楼
2011-07-06 09:22:08
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mobio有UltroClean和Power Soil DNA之分,后者对腐殖酸效果好。前者不是专门针对高腐殖酸土壤的。其次,它有一个troubleshooting,可以从上面找到一些解决的方法。
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14楼
2011-07-24 09:53:42
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