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vaivaiann

铜虫 (小有名气)


[交流] 湿地植物根际土壤微生物总DNA提取

最近在提取湿地土壤微生物总DNA提取,参考文献后想用以下步骤:称取土壤 0. 25g 至 2mL Eppendorf 管中, 用1mL pH8. 0 的PBS 缓冲液洗涤2 次。加入玻璃珠0. 5g 和 1mL 裂解液( CTAB 5% , SDS 1%, EDTA0. 1mol/ L, N aCl 0. 1mo l/ L, pH 8. 0) , 轻微振荡混合均匀后旋涡振荡2min; 10000g 离心1min,吸取上清液,加入NH4Ac至浓度2.5M,混合均匀4 ℃ 保温30min; 10000   g 离心 5min, 小心吸取上清液至干净的 1. 5mL Eppendorf 管中, 加入等体积异丙醇, -20℃ 保温 30min, 10000g 离心 5min, 弃上清,用 pH8. 0 的T E 溶液200微升 溶解沉淀物; DNA溶液用葡聚糖凝胶 Sephadex G75 柱层析纯化-20℃ 保存。
希望熟知DNA提取的大侠帮忙看一下,这个步骤中NH4Ac和异丙醇的作用是什么,据我了解到的他们都有沉淀DNA的作用,那“加入NH4Ac至浓度2.5M,混合均匀4 ℃ 保温30min; 10000   g 离心 5min, 小心吸取上清液至干净的 1. 5mL Eppendorf 管中”这一步不就把DNA都丢弃了吗?
求助了,求助了~~~
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dodoxxc

木虫 (正式写手)


★
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不知道你提土壤总dna的目的是啥,之前我们也试过一些方法,都不理想,后来还是用的试剂盒,算下来每个样品也没多贵,关键是节省了时间,提高了效率
2楼2012-08-08 10:50:22
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vaivaiann

铜虫 (小有名气)


提取之后想建基因文库,并且也要进行T-RFLP分析
3楼2012-08-08 17:18:48
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wangshuswfu

铜虫 (小有名气)


★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by vaivaiann at 2012-08-08 17:18:48
提取之后想建基因文库,并且也要进行T-RFLP分析

哪里的湿地?我也在做哦~上海还是内蒙古?
4楼2012-08-08 19:44:13
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vaivaiann

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
4楼: Originally posted by wangshuswfu at 2012-08-08 19:44:13
哪里的湿地?我也在做哦~上海还是内蒙古?...

我做得是北京的湿地,T-rflp怎么闭光操作的呢,我一直想不明白。见光对它的影响有多大?我是一点经验都没有啊,望指教。
6楼2012-08-13 21:40:56
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高雅丽

铁虫 (初入文坛)


★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
DNA在2mol左右的Nacl溶液中溶解度很大,估计这里醋酸钠的作用是增大DNA的溶解度的吧,而不是沉淀DNA.
7楼2013-04-10 15:29:52
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简单回复
2012-08-08 19:51   回复  
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