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【求助/交流】real time PCR如何去掉杂峰
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yangjianchen
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[交流]
【求助/交流】real time PCR如何去掉杂峰
在做定量PCR的时候溶解曲线中所要的峰旁边出现了一个稍低一点的峰,这个峰与需要的峰是相连的,请问是什么原因?如何解决!
谢谢
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1楼
2011-04-01 17:25:14
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西瓜
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Originally posted by
yangjianchen
at 2011-04-01 17:25:14:
在做定量PCR的时候溶解曲线中所要的峰旁边出现了一个稍低一点的峰,这个峰与需要的峰是相连的,请问是什么原因?如何解决!
谢谢
楼主你问题解决了没?呵呵~
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4楼
2011-04-26 00:57:25
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西瓜
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dhd997(金币+6, EPI+1): good 2011-04-01 20:02:24
yangjianchen(金币+1): 非常感谢,按照你的方法我再尝试下 2011-04-03 10:10:33
yangjianchen(金币+1): 2011-04-26 00:53:22
这个杂峰可能是非特异扩增的产物。可以尝试提高退火温度(如2℃),缩短延伸时间,降低引物浓度,降低镁离子浓度等方法。如不奏效,恐怕得重新设计引物了,尽量避免错配、引物二聚体的形成和发夹结构。
还有一个可能是基因组DNA的污染。
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2011-04-01 19:24:34
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★
小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖
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Originally posted by
yangjianchen
at 2011-04-01 17:25:14:
在做定量PCR的时候溶解曲线中所要的峰旁边出现了一个稍低一点的峰,这个峰与需要的峰是相连的,请问是什么原因?如何解决!
谢谢
……
今晚做了个Real-time PCR,出现跟你一样的情况了,并且阴性对照也有扩增,且阴性对照的峰还跟样品的峰位置一样,得出的定量结果也跟预期的差好远。估计我的引物也不好。明天把退火温度从55提高到60试试……God bless me……
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3楼
2011-04-26 00:56:23
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david_xmu
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):给个红包,谢谢回帖
dhd997(金币+3): good 2011-04-26 18:56:22
在设计引物的时候,注意一下扩增产物的大小,虽然说扩增产物越小,PCR效率越高,但是太小的话,比如70~80bp左右,跟引物二聚体差不多大,这样即使产生了引物二聚体,也无法通过溶解曲线或者跑胶来区分开,我一般都设计成120~150 bp左右吧。仅供参考。
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5楼
2011-04-26 05:54:56
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