24小时热门版块排行榜    

查看: 2267  |  回复: 11
本帖产生 1 个 MolEPI ,点击这里进行查看

yangjianchen

铜虫 (小有名气)


[交流] 【求助/交流】real time PCR如何去掉杂峰

在做定量PCR的时候溶解曲线中所要的峰旁边出现了一个稍低一点的峰,这个峰与需要的峰是相连的,请问是什么原因?如何解决!

谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+6, EPI+1): good 2011-04-01 20:02:24
yangjianchen(金币+1): 非常感谢,按照你的方法我再尝试下 2011-04-03 10:10:33
yangjianchen(金币+1): 2011-04-26 00:53:22
这个杂峰可能是非特异扩增的产物。可以尝试提高退火温度(如2℃),缩短延伸时间,降低引物浓度,降低镁离子浓度等方法。如不奏效,恐怕得重新设计引物了,尽量避免错配、引物二聚体的形成和发夹结构。
还有一个可能是基因组DNA的污染。
2楼2011-04-01 19:24:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by yangjianchen at 2011-04-01 17:25:14:
在做定量PCR的时候溶解曲线中所要的峰旁边出现了一个稍低一点的峰,这个峰与需要的峰是相连的,请问是什么原因?如何解决!

谢谢

……今晚做了个Real-time PCR,出现跟你一样的情况了,并且阴性对照也有扩增,且阴性对照的峰还跟样品的峰位置一样,得出的定量结果也跟预期的差好远。估计我的引物也不好。明天把退火温度从55提高到60试试……God bless me……
3楼2011-04-26 00:56:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
引用回帖:
Originally posted by yangjianchen at 2011-04-01 17:25:14:
在做定量PCR的时候溶解曲线中所要的峰旁边出现了一个稍低一点的峰,这个峰与需要的峰是相连的,请问是什么原因?如何解决!

谢谢

楼主你问题解决了没?呵呵~
4楼2011-04-26 00:57:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

david_xmu

金虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
dhd997(金币+3): good 2011-04-26 18:56:22
在设计引物的时候,注意一下扩增产物的大小,虽然说扩增产物越小,PCR效率越高,但是太小的话,比如70~80bp左右,跟引物二聚体差不多大,这样即使产生了引物二聚体,也无法通过溶解曲线或者跑胶来区分开,我一般都设计成120~150 bp左右吧。仅供参考。
5楼2011-04-26 05:54:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

david_xmu

金虫 (小有名气)


★ ★ ★
西瓜(金币+3): 是滴,一般有问题的话我也会去跑胶看看。 2011-04-26 20:06:24
引用回帖:
Originally posted by yangjianchen at 2011-04-01 17:25:14:
在做定量PCR的时候溶解曲线中所要的峰旁边出现了一个稍低一点的峰,这个峰与需要的峰是相连的,请问是什么原因?如何解决!

谢谢

有没有把PCR产物拿去跑胶看看,如果跑胶的结果是一条带,我觉得还是可以的。有的时候溶解曲线也不是那么准确的。
6楼2011-04-26 05:56:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

475502411

铜虫 (著名写手)


★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
西瓜(金币+2): 有可能 2011-04-26 19:55:13
引用回帖:
Originally posted by 西瓜 at 2011-04-01 19:24:34:
这个杂峰可能是非特异扩增的产物。可以尝试提高退火温度(如2℃),缩短延伸时间,降低引物浓度,降低镁离子浓度等方法。如不奏效,恐怕得重新设计引物了,尽量避免错配、引物二聚体的形成和发夹结构。
还有一个 ...

我之前也出现过阴性出现峰的情况,可能是引物或者是水污染了
7楼2011-04-26 19:13:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangjianchen

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
1122979楼: Originally posted by 西瓜 at 2011-04-26 00:57:25
楼主你问题解决了没?呵呵~...

我感觉可能是试剂的问题了,对于同样的模板和引物,宝生物的特异性要比天根好一些,当然成本也要高啦。
8楼2012-07-09 11:06:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangjianchen

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
1123035楼: Originally posted by david_xmu at 2011-04-26 05:56:51
有没有把PCR产物拿去跑胶看看,如果跑胶的结果是一条带,我觉得还是可以的。有的时候溶解曲线也不是那么准确的。...

但是说是这么说,但是大家公认的还是要看溶解曲线啊
9楼2012-07-09 11:07:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangjianchen

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
1125844楼: Originally posted by 475502411 at 2011-04-26 19:13:16
我之前也出现过阴性出现峰的情况,可能是引物或者是水污染了...

阴性出现污染很正常的,只是说这个不是阴性
10楼2012-07-09 11:07:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
引用回帖:
1270037楼: Originally posted by yangjianchen at 2012-07-09 11:06:24
我感觉可能是试剂的问题了,对于同样的模板和引物,宝生物的特异性要比天根好一些,当然成本也要高啦。...

搞定了就好
11楼2012-07-09 12:15:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangjianchen

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
1270046楼: Originally posted by 西瓜 at 2012-07-09 12:15:36
搞定了就好...

嗯嗯嗯,谢啦
12楼2012-07-12 17:33:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yangjianchen 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 354求调剂 +6 Tyoumou 2026-03-18 9/450 2026-03-21 20:47 by lbsjt
[考研] 278求调剂 +9 烟火先于春 2026-03-17 9/450 2026-03-21 17:47 by 学员8dgXkO
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-18 3/150 2026-03-21 17:31 by ColorlessPI
[考研] 求调剂 +3 白QF 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:12 by zhukairuo
[考研] 0856材料专硕353求调剂 +3 NIFFFfff 2026-03-20 3/150 2026-03-21 10:23 by luoyongfeng
[考研] 306求调剂 +4 chuanzhu川烛 2026-03-18 4/200 2026-03-21 08:25 by laoshidan
[考研] 机械专硕299求调剂至材料 +3 kkcoco25 2026-03-16 4/200 2026-03-21 03:52 by JourneyLucky
[考研] 材料工程(专)一志愿985 初试335求调剂 +3 hiloiy 2026-03-17 4/200 2026-03-21 03:04 by JourneyLucky
[考研] 化学求调剂 +4 临泽境llllll 2026-03-17 5/250 2026-03-21 02:23 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华中科技大学,080502,354分求调剂 +5 守候夕阳CF 2026-03-18 5/250 2026-03-21 01:06 by JourneyLucky
[考研] 317求调剂 +5 申子申申 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:26 by JourneyLucky
[考研] 350求调剂 +5 weudhdk 2026-03-19 5/250 2026-03-20 22:04 by luoyongfeng
[考研] 北科281学硕材料求调剂 +5 tcxiaoxx 2026-03-20 5/250 2026-03-20 21:35 by laoshidan
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:35 by 学员8dgXkO
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +7 困于星晨 2026-03-17 9/450 2026-03-20 17:38 by 无懈可击111
[考研] 0703化学调剂 +4 18889395102 2026-03-18 4/200 2026-03-19 16:13 by 30660438
[考研] 一志愿苏州大学材料工程(085601)专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +6 大火山小火山 2026-03-16 8/400 2026-03-17 15:05 by 无懈可击111
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
[考研] [导师推荐]西南科技大学国防/材料导师推荐 +3 尖角小荷 2026-03-16 6/300 2026-03-16 23:21 by 尖角小荷
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
信息提示
请填处理意见