24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 3238  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

忧游鸟

铜虫 (小有名气)


[交流] 【求助/交流】紧急求助~~ 关于简并引物设计 codehop 和genefisher 在线

求助关于简并引物设计的问题,希望各位大虾帮忙

   本人做的是漆酶基因多样性的东西,这是dnaman中比对的ncbi 下载的序列,有四个部分出现的保守区域还是不少,命名为1 2 3 4,放到codehop中之后要自己肉眼判断保守区域的那一段 然后手动设计引物么??学环境的 好多东西实在是不懂~~ 希望大家不吝赐教啊~

[ Last edited by 忧游鸟 on 2011-3-31 at 20:28 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ample1007

银虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不错,讲的还挺详细。
我个人经验是,一个问题,在看了不同的帖子后,把一个问题的不同解释都综合起来再看的话,你那是可能就豁然开朗了!
11楼2012-09-02 09:02:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

csdyg

木虫 (正式写手)



1949stone(金币+1): 呵呵 不错 2011-03-28 10:35:47
我有一些这方面的经验,codehop用了几次,还不错,这会没时间,等我下了班回去再给你说,或者你能详细说你一下你的情况

[ Last edited by csdyg on 2011-3-26 at 19:09 ]
2楼2011-03-26 01:13:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

csdyg

木虫 (正式写手)


★ ★ ★
dhd997(金币+3): 很热心,在这里讨论不方便吗? 2011-03-26 08:49:06
忧游鸟(金币+20): 2011-03-26 11:06:43
在CODEHOP里粘贴进你要比对的序列,生成比对结果之后,用引物设计,软件会自动在保守区序列上生成引物。

但是生成的引物效率并不一定很高,根据我的经验,你最好人工检查,然后根据codehop的基本设计原则自己设计引物
3楼2011-03-26 05:11:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

忧游鸟

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by csdyg at 2011-03-26 05:11:41:
在CODEHOP里粘贴进你要比对的序列,生成比对结果之后,用引物设计,软件会自动在保守区序列上生成引物。

但是生成的引物效率并不一定很高,根据我的经验,你最好人工检查,然后根据codehop的基本设计原则自己设 ...

是的 就是放进去比对了之后又很多什么block unknown A B C D E  之类的了 然后分值都是六十多 最后还是要根据自己的保守区域来选取么  需要反过来查找相应的碱基序列来选择密码子的偏好性的碱基么
4楼2011-03-26 11:19:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 071000生物学求调剂,初试成绩343 +7 小小甜面团 2026-03-25 7/350 2026-03-28 20:25 by 唐沐儿
[考研] 085600,专业课化工原理,321分求调剂 +3 大馋小子 2026-03-28 3/150 2026-03-28 20:10 by wxiongid
[考研] 289求调剂 +11 新时代材料 2026-03-27 11/550 2026-03-28 18:09 by YK。。
[考研] 一志愿华北电力大学能动专硕,293,求调剂 +3 15537177284 2026-03-23 5/250 2026-03-28 16:11 by xxxsssccc
[考研] 一志愿中南大学化学0703总分337求调剂 +5 niko- 2026-03-27 5/250 2026-03-28 14:25 by 唐沐儿
[考研] 329求调剂 +6 星野? 2026-03-26 6/300 2026-03-28 14:14 by 唐沐儿
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-03-27 6/300 2026-03-28 14:10 by 唐沐儿
[考研] 材料求调剂一志愿哈工大324 +7 闫旭东 2026-03-28 9/450 2026-03-28 08:51 by Xu de nuo
[考研] 315分求调剂 +7 26考研上岸版26 2026-03-26 7/350 2026-03-28 04:05 by fmesaito
[考研] 352分 化工与材料 +5 海纳百川Ly 2026-03-27 5/250 2026-03-28 03:39 by fmesaito
[考研] 求调剂 +4 零八# 2026-03-27 4/200 2026-03-27 18:07 by yu221
[考研] 材料与化工085600,总分304,本科有两篇sci参与,求调剂 +10 幸运的酱酱 2026-03-22 12/600 2026-03-27 16:08 by muchong357
[考博] 26申博 +3 加油冲啊! 2026-03-26 3/150 2026-03-27 15:38 by cls512
[考研] 298调剂 +3 jiyingjie123 2026-03-27 3/150 2026-03-27 11:57 by wxiongid
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +4 崔wj 2026-03-26 4/200 2026-03-27 08:04 by chemisry
[考研] 317求调剂 +7 蛋黄咸肉粽 2026-03-26 7/350 2026-03-27 02:29 by fmesaito
[考研] 325求调剂 +3 Aoyijiang 2026-03-23 3/150 2026-03-26 20:46 by 不吃魚的貓
[考研] 334分 一志愿武理 材料求调剂 +4 李李不服输 2026-03-26 4/200 2026-03-26 16:00 by 不吃魚的貓
[考研] 289材料与化工(085600)B区求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-22 5/250 2026-03-25 08:20 by mx.yue
[考研] 336化工调剂 +4 王大坦1 2026-03-23 5/250 2026-03-23 18:32 by allen-yin
信息提示
请填处理意见