应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】从同源建模开始，一个完整的分子对接实验需要多久？
南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知（长期有效）
51/1返回列表
查看: 3078  |  回复: 7
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

lzrlt

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】从同源建模开始，一个完整的分子对接实验需要多久？已有3人参与

想做药物分子和两个酶的分子对接，一个需要同源建模，一个不需要，结合位点都不知道，我想问同源建模加上后面的对接的过程，整个实验大概需要多长时间？不需要同源建模的又需要多久？

[ Last edited by lzrlt on 2011-3-12 at 16:55 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

蛋白模拟与改造

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2011-03-12 16:52:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lizhuo0205

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-03-12 22:39:18
引用回帖:
Originally posted by lzrlt at 2011-03-12 17:38:21:
那在电脑上计算的时间会不会很久？

单纯对接的环节的话，要看你的小分子的库多大，还要看你用哪个软件做，时间差距还是很大的
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2011-03-12 20:22:32
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by lzrlt at 2011-03-12 16:52:58:
想做药物分子和两个酶的分子对接，一个需要同源建模，一个不需要，结合位点都不知道，我想问同源建模加上后面的对接的过程，整个实验大概需要多长时间？不需要同源建模的又需要多久？

[ Last edited by lzrlt ...

这个得分具体情况，还不一定能得到好的结果
同源模建你要使用SWISS-MODEL的话花5min看看教程就能学会了
对接不知道位点你得去看相关文献报道类似酶的结合位点，这个时间不可估计
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-03-12 17:07:57
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lzrlt

铁虫 (初入文坛)
zh1987hs: 看你要对接的分子多不多，此外，看软件 2011-03-12 22:39:00
引用回帖:
Originally posted by zh1987hs at 2011-03-12 17:07:57:
这个得分具体情况，还不一定能得到好的结果
同源模建你要使用SWISS-MODEL的话花5min看看教程就能学会了
对接不知道位点你得去看相关文献报道类似酶的结合位点，这个时间不可估计

那在电脑上计算的时间会不会很久？
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-03-12 17:38:21
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lzrlt

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by lizhuo0205 at 2011-03-12 20:22:32:
单纯对接的环节的话，要看你的小分子的库多大，还要看你用哪个软件做，时间差距还是很大的

不是很多，十来个化合物，打算用sybyl和DS做…………同源建模的是不是很快就计算好？不把分子动力学模拟算在内的话………………

[ Last edited by lzrlt on 2011-3-12 at 20:49 ]
赞一下 回复此楼
5楼2011-03-12 20:46:08
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭