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lzrlt

铁虫 (初入文坛)

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[交流] 【求助】从同源建模开始，一个完整的分子对接实验需要多久？已有3人参与

想做药物分子和两个酶的分子对接，一个需要同源建模，一个不需要，结合位点都不知道，我想问同源建模加上后面的对接的过程，整个实验大概需要多长时间？不需要同源建模的又需要多久？

[ Last edited by lzrlt on 2011-3-12 at 16:55 ]

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1楼2011-03-12 16:52:58

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lizhuo0205

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zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-03-12 22:39:18

引用回帖:

Originally posted by lzrlt at 2011-03-12 17:38:21:
那在电脑上计算的时间会不会很久？

单纯对接的环节的话，要看你的小分子的库多大，还要看你用哪个软件做，时间差距还是很大的

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4楼2011-03-12 20:22:32

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lizhuo0205

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zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-03-15 22:22:03

引用回帖:

Originally posted by lzrlt at 2011-03-12 20:46:08:
不是很多，十来个化合物，打算用sybyl和DS做…………同源建模的是不是很快就计算好？不把分子动力学模拟算在内的话………………

[ Last edited by lzrlt on 2011-3-12 at 20:49 ]

同源建模很快，几分钟，至少我用的是，呵呵，至于有没有精度很高比较耗时的，我就不知道了，呵呵，我也是初学者而已，大家交流一下吧，哈哈
10来个化合物的话应该很快，不过不记得你之前的帖子有没有说是已知靶点还是blind docking啊？如果已知靶点的话很快的