24小时热门版块排行榜    

查看: 2596  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lzrlt

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】从同源建模开始,一个完整的分子对接实验需要多久?已有3人参与

想做药物分子和两个酶的分子对接,一个需要同源建模,一个不需要,结合位点都不知道,我想问同源建模加上后面的对接的过程,整个实验大概需要多长时间?不需要同源建模的又需要多久?

[ Last edited by lzrlt on 2011-3-12 at 16:55 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘贴专辑推荐

蛋白模拟与改造

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lzrlt

铁虫 (初入文坛)

zh1987hs: 看你要对接的分子多不多,此外,看软件 2011-03-12 22:39:00
引用回帖:
Originally posted by zh1987hs at 2011-03-12 17:07:57:
这个得分具体情况,还不一定能得到好的结果
同源模建你要使用SWISS-MODEL的话花5min看看教程就能学会了
对接不知道位点你得去看相关文献报道类似酶的结合位点,这个时间不可估计

那在电脑上计算的时间会不会很久?
3楼2011-03-12 17:38:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by lzrlt at 2011-03-12 16:52:58:
想做药物分子和两个酶的分子对接,一个需要同源建模,一个不需要,结合位点都不知道,我想问同源建模加上后面的对接的过程,整个实验大概需要多长时间?不需要同源建模的又需要多久?

[ Last edited by lzrlt ...

这个得分具体情况,还不一定能得到好的结果
同源模建你要使用SWISS-MODEL的话花5min看看教程就能学会了
对接不知道位点你得去看相关文献报道类似酶的结合位点,这个时间不可估计
2楼2011-03-12 17:07:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lizhuo0205

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-03-12 22:39:18
引用回帖:
Originally posted by lzrlt at 2011-03-12 17:38:21:
那在电脑上计算的时间会不会很久?

单纯对接的环节的话,要看你的小分子的库多大,还要看你用哪个软件做,时间差距还是很大的
4楼2011-03-12 20:22:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lzrlt

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by lizhuo0205 at 2011-03-12 20:22:32:
单纯对接的环节的话,要看你的小分子的库多大,还要看你用哪个软件做,时间差距还是很大的

不是很多,十来个化合物,打算用sybyl和DS做…………同源建模的是不是很快就计算好?不把分子动力学模拟算在内的话………………

[ Last edited by lzrlt on 2011-3-12 at 20:49 ]
5楼2011-03-12 20:46:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 怎么带研究生? +4 豆豆小小2 2024-06-20 4/200 2024-06-20 14:41 by cnofc
[考博] 这个博士要读吗 +15 Sea Breeze 2024-06-16 29/1450 2024-06-20 14:30 by Sea Breeze
[硕博家园] 豫北虫友互识 +11 xuhongli903 2024-06-18 12/600 2024-06-20 13:32 by 1429524838
[基金申请] 刚刚收到科研之友邮件 +18 olivermiaoer 2024-06-19 25/1250 2024-06-20 12:34 by 凌绝顶
[考博] 一名额难求啊 +3 pinbo拼搏 2024-06-19 3/150 2024-06-20 10:38 by 安塔瓦拉多
[基金申请] 江南大学到瑞士招聘,称取消非升即走,改预聘+长聘 +21 babu2015 2024-06-18 22/1100 2024-06-19 23:03 by feng6531
[基金申请] F口信息学部拿面上,大概需要什么样的成果 +7 _奋黎_ 2024-06-16 18/900 2024-06-19 20:02 by _奋黎_
[论文投稿] 审稿 +5 香瓜木香 2024-06-19 6/300 2024-06-19 17:44 by xli1984
[论文投稿] ACS AMI 返回审稿意见,一个大修,两个据稿,编辑给的修改重投 +5 智商已更新 2024-06-19 5/250 2024-06-19 12:35 by nono2009
[公派出国] 去英国的小伙伴儿都在哪儿租的房子呀? +7 65syn 2024-06-14 11/550 2024-06-19 10:19 by 65syn
[硕博家园] 关于硕博连读的一些疑问? +8 Lwenter 2024-06-14 10/500 2024-06-19 10:00 by qingdao001
[基金申请] 博后基金刷到的BUG,图片来的更直观 +15 carolloo 2024-06-17 16/800 2024-06-19 09:42 by msjy
[论文投稿] 审稿人含糊拒稿,还需要回复吗?如何回复? 20+4 BruceChum 2024-06-15 22/1100 2024-06-19 08:00 by kanyechris
[考博] 2025考博 +8 自强不息a?a 2024-06-15 13/650 2024-06-18 18:12 by 投必得科研顾问
[有机交流] 跑板能跑开,过柱过不纯怎么办 +4 小胡在努力 2024-06-18 6/300 2024-06-18 15:20 by long8811
[论文投稿] 论文已接收,但发现修改稿传的是旧版该怎么办? +3 zsq54321 2024-06-15 6/300 2024-06-17 19:45 by wjykycg
[基金申请] 面青地会评时间 +8 tanjydd 2024-06-15 8/400 2024-06-17 17:08 by 小龙虾2008
[基金申请] 博后基金,博管会会提前知道消息吗? +4 yuyiang 2024-06-13 4/200 2024-06-16 11:40 by yangyuzhong4
[基金申请] 博士后创新人才支持计划公示 +9 aishida144 2024-06-14 15/750 2024-06-16 09:52 by msjy
[基金申请] 博后基金,以往的结果点不开,怎么回事呢?最后一次机会了,两次都没中前面。 +7 kyukitu 2024-06-14 13/650 2024-06-15 06:46 by 我是王小帅
信息提示
请填处理意见