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[交流]
【求助/交流】关于建立cDNA文库的诸多问题,拜请解答
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1、clontech的smarter kit大家有米有用过?效果怎样? invitrogen的有用过的米?多少钱买的?效果捏? 2、质粒文库跟酵母文库差别大吗?我想筛est,然后做表达。 3、clontech的技术客服说起始不用mRNA也可以,用总RNA就行,还声称10ng总RNA就可以。大家觉得靠谱吗? 4、关于mRNA质量的验证,说是有smear,smear是什么样子的?能否提供图片,实在不行文字说明,举例子,打比方都行。 5、载体选择上有没有什么讲究? To check quality, analyze 100 ng of your mRNA using a Bioanalyzer, or by performing agarose gel electrophoresis using a 1% E-Gel® EX Gel (see page 45 for ordering information). Your mRNA will appear as a smear, with the greatest intensity in the range of 1 to 3 kb. Some rRNA bands may still be faintly visible. If you do not detect a smear, or if the majority of the smear is significantly lessthan 1 kb, you will need to repeat the RNA isolation. Be sure to follow the recommendations listed on the previous page to prevent RNase contamination. 这里关于mRNA电泳的描述,我能否认为smear是弥散的条带。。。。 谢谢各位啦!! 鞠躬!! [ Last edited by sai00fuji on 2011-2-26 at 20:42 ] |
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1.用过clontech的不错,invitrogen的没有用过,不敢评价,不过invitrogen也是大牌子,具体选择什么试剂盒还是楼主你比较一下两个试剂盒的说明书最好 2.通常的文库都是测序用的,除非特殊的试剂盒,例如酵母双杂交文库试剂盒。我看你的目的应该就是构建一个普通的cDNA文库,然后测序,然后选择目的的基因酵母表达吧。 3.clontech的SMART就是直接用的总RNA,你看一下说明书就知道了,不用纯化mRNA的 4.smear说的是双链cDNA,类似于沙发发的图,好的双链图谱是smear+几条特征带,因样品不同而异 5.不知道你说的什么载体,是构建文库的载体吗,每一种试剂盒都有固定的载体。一般选择质粒的载体吧 |
4楼2011-02-25 22:51:39
brightfuture01
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再具体问一下,clontech的kit,起始需要总RNA大约多少?全长率能达到多少? To check quality, analyze 100 ng of your mRNA using a Bioanalyzer, or by performing agarose gel electrophoresis using a 1% E-Gel® EX Gel (see page 45 for ordering information). Your mRNA will appear as a smear, with the greatest intensity in the range of 1 to 3 kb. Some rRNA bands may still be faintly visible. If you do not detect a smear, or if the majority of the smear is significantly lessthan 1 kb, you will need to repeat the RNA isolation. Be sure to follow the recommendations listed on the previous page to prevent RNase contamination. 这里关于mRNA电泳的描述,我能否认为smear是弥散的条带。。。。 谢谢~ |
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