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汕头大学海洋科学接受调剂
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sai00fuji

金虫 (正式写手)


[交流] 【求助/交流】关于建立cDNA文库的诸多问题,拜请解答

1、clontech的smarter kit大家有米有用过?效果怎样?
   invitrogen的有用过的米?多少钱买的?效果捏?
2、质粒文库跟酵母文库差别大吗?我想筛est,然后做表达。
3、clontech的技术客服说起始不用mRNA也可以,用总RNA就行,还声称10ng总RNA就可以。大家觉得靠谱吗?
4、关于mRNA质量的验证,说是有smear,smear是什么样子的?能否提供图片,实在不行文字说明,举例子,打比方都行。
5、载体选择上有没有什么讲究?


To check quality, analyze 100 ng of your mRNA using a Bioanalyzer, or by
performing agarose gel electrophoresis using a 1% E-Gel® EX Gel (see page 45 for ordering information). Your mRNA will appear as a smear, with the greatest intensity in the range of 1 to 3 kb. Some rRNA bands may still be faintly visible. If you do not detect a smear, or if the majority of the smear is significantly lessthan 1 kb, you will need to repeat the RNA isolation. Be sure to follow the recommendations listed on the previous page to prevent RNase contamination.


这里关于mRNA电泳的描述,我能否认为smear是弥散的条带。。。。



谢谢各位啦!!
鞠躬!!

[ Last edited by sai00fuji on 2011-2-26 at 20:42 ]
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路人甲007

木虫 (正式写手)


我没有纯化过mRNA,我都是用总RNA直接做的,
RNA样品也跑胶,我主要是看18S和28SRNA条带 通过跑全RNA看是否降解的
7楼2011-02-26 19:49:38
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翱宇(金币+1): 谢谢交流 2011-02-25 21:32:05
sai00fuji(金币+8): 谢谢 2011-02-25 22:04:23
1, 这些试剂盒价格都不菲,我没有用过。见过视频上用过Cosmid or Fosmid eDNA library Kit,感觉不错。

4,可以给你提供一个smear 的图片:

5,做文库时候载体要高效,比如连接效率,转化效率;另外还有满足容纳片段的大小要求。
2楼2011-02-25 21:31:38
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sai00fuji

金虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2011-02-25 21:31:38:
1, 这些试剂盒价格都不菲,我没有用过。见过视频上用过Cosmid or Fosmid eDNA library Kit,感觉不错。

4,可以给你提供一个smear 的图片:

5,做文库时候载体要 ...

请问是什么视频啊?哪家公司的?
这两个都是smear吗?mRNA纯化的好是这样吗?
3楼2011-02-25 22:05:44
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路人甲007

木虫 (正式写手)


★ ★ ★
lstt09nk(金币+3): 鼓励参与交流 2011-02-26 09:05:29
sai00fuji(金币+12): 2011-02-26 17:15:37
1.用过clontech的不错,invitrogen的没有用过,不敢评价,不过invitrogen也是大牌子,具体选择什么试剂盒还是楼主你比较一下两个试剂盒的说明书最好
2.通常的文库都是测序用的,除非特殊的试剂盒,例如酵母双杂交文库试剂盒。我看你的目的应该就是构建一个普通的cDNA文库,然后测序,然后选择目的的基因酵母表达吧。
3.clontech的SMART就是直接用的总RNA,你看一下说明书就知道了,不用纯化mRNA的
4.smear说的是双链cDNA,类似于沙发发的图,好的双链图谱是smear+几条特征带,因样品不同而异
5.不知道你说的什么载体,是构建文库的载体吗,每一种试剂盒都有固定的载体。一般选择质粒的载体吧
4楼2011-02-25 22:51:39
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