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xtcao668

至尊木虫 (著名写手)

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虫号: 481086

[交流] 【求助/交流】酿酒酵母URA3基因敲除的问题

个人目前做酿酒酵母过表达的研究，由于所用质粒上的筛选标记是URA3(尿嘧啶)营养缺陷，而目标菌株是工业二倍体酵母。所以就根据文献利用5-FOA (5-氟乳清酸)通过PCR产物(两端带有URA3同源片段，中间为G418筛选标记的PCR产物)方法直接转化工业二倍体酵母，一开始5-FOA浓度为0.2mg/ml 和2mg/ml 结果高浓度的平板不长，低浓度5-FOA的平板长满；后来用利用YPD加G418筛选，结果利用SD/SD-URA培养基验证时发现都能生长；
接下来先测定了二倍体酵母5-FOA的抗性，发现0.5mg/ml ,1mg/ml 不能生长，现在利用SD-URA-5-FOA-G418 平板来筛选，结果在1mg/ml 5-FOA G418浓度为120ug/ml 平板上长出菌落，但是再次利用SD/SD-URA 培养基验证时发现又全部能够生长，正常情况应该是SD不生长，只有补加URA3的SD才能生长。请问各位虫友我的问题出在哪里？是不是应该将酵母单倍体话后再转化啊？
比较啰嗦见谅！谢谢帮忙

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1楼 2011-01-13 09:13:08

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susizheng

木虫 (著名写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

引用回帖:

18楼: Originally posted by 冰艺于欣然 at 2013-11-08 10:20:49
我要用酿酒酵母做基因的过表达，老师说我们现在的菌株是工业菌株，是二倍体，不太好做，我最近在网上查菌株呢。ATCC 204508是很多突变株的亲代菌株，那是不是是二倍体啊？还有很多文献用到Saccharomyces cerevisia ...

你好，做酿酒酵母好像是三四年前的事了，二倍体做基因敲除是麻烦。但是做过表达并不影响啊。用二倍体做一样的，即使转进去一半一样可以表达。另外我只用过WT strain (BY4741 [genotype, Mata his3Δ1 leu2Δ0 met15Δ0 ura3Δ0])这个菌株，也是二倍体的。

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19楼2013-11-08 11:17:07

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susizheng

木虫 (著名写手)

★ ★
rainwander(金币+2):鼓励积极参与交流~~~ 2011-01-13 10:09:58
xtcao668(金币+1): 2011-01-13 10:18:20

1、竟然是二倍体，你敲除的时候可能只是敲除了一半，因此一开始用SD/SD-URA筛选肯定的不容易得到预期结果，应该一开始用高浓度抗生素筛选，通过抗生素筛选后，再用SD/SD-URA筛选，如果通过抗生素筛选后不能通过SD/SD-URA，说明只敲除了一半，要重新设计引物二次敲除。
2、最好不要选取工业二倍体酵母作为实验酵母，分子操作上会很麻烦，最好选用试验用的单倍体酵母。
3、酿酒酵母dropout类型现在又很多了，搞到一个URA3缺陷型的菌株也不难，何必自己敲除，费时又费力。

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2楼2011-01-13 09:41:17

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